RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 GLB1L2Q8IW92 636 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 OR1L3Q8NH93 324 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 TMEM106AQ96A25 262 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 NXPE2Q96DL1 559 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DLL4Q9NR61 685 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 A0A0A6YYH2 397 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 TVP23AA6NH52 213 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 A6NJ64 397 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 SDC3O75056 442 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 NDUFB6O95139 128 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 NUDT14O95848 222 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ZNF24P17028 368 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 NAGAP17050 411 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 FSTP19883 344 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DNASE1P24855 282 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 GLO1Q04760 184 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ACKR1Q16570 336 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 MARCH3Q86UD3 253 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DEFB123Q8N688 67 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 SLX1AQ9BQ83 275 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ELOVL3Q9HB03 270 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 CKLFQ9UBR5 152 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 CACNA1EQ15878 2313 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 A6NL46 340 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 PSMD9O00233 223 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 SLC17A2O00624 439 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 PLPP3O14495 311 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 AKR7A2O43488 359 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ICMTO60725 284 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 IFNA7P01567 189 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DCNP07585 359 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ADRB1P08588 477 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 GIPP09681 153 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 RIDAP52758 137 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 GLT8D1Q68CQ7 371 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 TEX261Q6UWH6 196 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 SORCS2Q96PQ0 1159 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 NOX3Q9HBY0 568 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 U3KQ87 197 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 LINC00862A6NCI5 91 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 CYC1P08574 325 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 SOX2P48431 317 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 RAP2BP61225 183 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DHODHQ02127 395 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DMWDQ09019 674 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 C17orf67Q0P5P2 114 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 KCNAB1Q14722 419 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 RAB11BQ15907 218 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 WDR38Q5JTN6 314 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 IZUMO1Q8IYV9 350 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 PRSS35Q8N3Z0 413 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 NUBPLQ8TB37 319 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 PTX4Q96A99 478 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 PISDQ9UG56 409 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 GGT3PA6NGU5 568 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 SMLR1H3BR10 107 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 ZNF208O43345 1280 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 GMDSO60547 372 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 HLA-DQA2P01906 255 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 PNLIPP16233 465 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 CXCL3P19876 107 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 KIR3DL2P43630 455 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 CXCL12P48061 93 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 DAP3P51398 398 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 OR1D5P58170 312 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-203ENST00000402697 SQSTM1Q13501 440 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms