RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 RP2O75695 350 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB3DO95716 219 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCNE2O96020 404 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV2-5P01817 119 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 FGF1P05230 155 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 FDFT1P37268 417 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIR3DL2P43630 455 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDK16Q00536 496 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAB21L1Q13394 359 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGAP19Q14CB8 494 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 RGNQ15493 299 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAF9Q16594 264 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 DGUOKQ16854 277 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 NADK2Q4G0N4 442 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 SFT2D3Q587I9 215 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4F3Q6IEY1 312 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 HDDC2Q7Z4H3 204 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC52Q8N7C0 313 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 MFSD9Q8NBP5 474 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 NOXO1Q8NFA2 376 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 COQ8AQ8NI60 647 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM3DQ96BQ1 224 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM59Q9BXS4 323 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV39A0A0B4J263 110 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBXN8O00124 270 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 RHOBTB1O94844 696 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 APCSP02743 223 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF806P0C7X5 589 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 HRH1P35367 487 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERPINB5P36952 375 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDKN1BP46527 198 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 RFX3P48380 749 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRRX1P54821 245 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 OGDHQ02218 1023 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF92Q03936 586 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF616Q08AN1 781 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFT88Q13099 833 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZSCAN26Q16670 478 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCTD21Q4G0X4 260 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SAXO2Q658L1 398 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFP1Q6P2D0 407 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 VSTM4Q8IW00 320 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 C15orf40Q8WUR7 153 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF681Q96N22 645 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 P2RX4Q99571 388 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPA2Q9H2U2 334 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 RIBC2Q9H4K1 309 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM49BQ9NUQ9 324 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMOXQ9NWM0 555 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADGRL1O94910 1474 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 C17orf51A8MQB3 221 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 LGALS9O00182 355 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCL21O00585 134 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHST1O43916 411 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 FCMRO60667 390 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR7A10O76100 309 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 UTS2O95399 124 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHDP01880 384 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 HLA-DQA1P01909 254 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCK1P16333 377 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TGFBR1P36897 503 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CXCL12P48061 93 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP1B3P54709 279 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDZK1Q5T2W1 519 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 GALNT17Q6IS24 598 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARL9Q6T311 187 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEX43Q6ZNM6 134 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM135Q86UB9 458 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 LHFPL3Q86UP9 236 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4K5Q8NGD3 323 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR8U1Q8NH10 309 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC01560Q8TB33 94 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM110BQ8TC76 370 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM54Q969K7 222 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEKT3Q9BXF9 490 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MFFQ9GZY8 342 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 UVRAGQ9P2Y5 699 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 MMACHCQ9Y4U1 282 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 IKBKGQ9Y6K9 419 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDHR2Q9BYE9 1310 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 NID2Q14112 1375 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP10AO60312 1499 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA8SH3BPF8 625 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 YIF1AO95070 293 aa1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms