RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 CD37P11049 281 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SOX18P35713 384 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RGS4P49798 205 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GUCA2AQ02747 115 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PTSQ03393 145 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HYAL1Q12794 435 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PSG3Q16557 428 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF9Q16594 264 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 UGCGQ16739 394 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FBLN7Q53RD9 439 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR27Q6MZM9 219 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM107Q6UX40 140 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PTX4Q96A99 478 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 P2RX4Q99571 388 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TUBA4BQ9H853 241 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DLL4Q9NR61 685 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GALPQ9UBC7 116 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 VCANP13611 3396 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR75O95800 540 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PSG1P11464 419 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CPEP16870 476 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP2K3P46734 347 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ST3GAL3Q11203 375 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LAX1Q8IWV1 398 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ABI3Q9P2A4 366 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 H0YIG0 161 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 P2RY10O00398 339 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 AIREO43918 545 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GADD45AP24522 165 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HTR4Q13639 388 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SHHQ15465 462 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF613Q6PF04 617 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 STPG4Q8N801 248 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SMPDL3BQ92485 455 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LOXL4Q96JB6 756 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DDOQ99489 341 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NPTNQ9Y639 398 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE6DO43924 150 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MSCO60682 206 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TOMM40O96008 361 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ALDOBP05062 364 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ACP2P11117 423 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FCGR1AP12314 374 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GGT2P36268 569 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 UCN3Q969E3 161 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TAAR8Q969N4 342 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 BHLHE40O14503 412 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 UTS2O95399 124 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR56A5P0C7T3 313 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms