RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354662.5

LMO3-204, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,574 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-204ENST00000354662 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 COPS8Q99627 209 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 GPR34Q9UPC5 381 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PPP5D1E7EU14 171 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ZNF264O43296 627 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ITGB2P05107 769 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PNLIPP16233 465 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PRRX1P54821 245 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ST8SIA6P61647 398 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 RPS14P62263 151 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PPTC7Q8NI37 304 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 Q8WTZ3 238 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CDK15Q96Q40 435 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PADI1Q9ULC6 663 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 C1orf226A1L170 272 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 VAMP5O95183 116 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PPP1R3DO95685 299 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 RPN2P04844 631 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 UCHL1P09936 223 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 IGFALSP35858 605 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 KIR3DL1P43629 444 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 LPAR6P43657 344 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 GEMP55040 296 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 MESP2Q0VG99 397 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SCAPQ12770 1279 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 AMHR2Q16671 573 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SPPL2AQ8TCT8 520 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 GRHL3Q8TE85 626 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 GPR87Q9BY21 358 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 HRH4Q9H3N8 390 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 DPEP2Q9H4A9 486 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ACOT7O00154 380 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 FAAHO00519 579 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 COCHO43405 550 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SLC16A8O95907 504 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CXCL1P09341 107 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 OR4A8P0C604 315 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ATF1P18846 271 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 MAOAP21397 527 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 GJA4P35212 333 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 FHITP49789 147 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CACNG1Q06432 222 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CAPSQ13938 189 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PSG3Q16557 428 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PPCDCQ96CD2 204 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PLXNA3P51805 1871 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 TMEM150BA6NC51 233 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 TMEM235A6NFC5 223 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 C22orf46C9J442 243 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 HBP1O60381 514 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 HLA-DQB2P05538 268 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CCKARP32238 428 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SNCAP37840 140 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CHRNA4P43681 627 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 CLDN18P56856 261 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SLC35A1P78382 337 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 PRDX4Q13162 271 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-204ENST00000354662 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms