RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 MCCC2Q9HCC0 563 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 NDRG3Q9UGV2 375 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 CDC14CA4D256 554 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 GNB5O14775 395 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 TO15178 435 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 HPGDP15428 266 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF626Q68DY1 528 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 Q6ZTK2 550 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 MEIOBQ8N635 442 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ORAI1Q96D31 301 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 PRRX2Q99811 253 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 HRASLSQ9HDD0 168 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 PCP4L1A6NKN8 68 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 OR6C76A6NM76 312 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 GABARAPH6UMI1 98 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 DVL2O14641 736 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ICOSLGO75144 302 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 GPR143P51810 404 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 NRG3P56975 720 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 SKP2Q13309 424 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 PHF19Q5T6S3 580 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 TMUB2Q71RG4 321 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 SLC29A4Q7RTT9 530 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 CDH26Q8IXH8 852 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 LNX2Q8N448 690 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 BMPERQ8N8U9 685 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF441Q8N8Z8 693 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF454Q8N9F8 522 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 BBS1Q8NFJ9 593 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 OR1S1Q8NH92 325 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 COQ8AQ8NI60 647 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 C15orf40Q8WUR7 153 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 C3orf49Q96BT1 292 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 TIMP4Q99727 224 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 CDCP1Q9H5V8 836 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 APMAPQ9HDC9 416 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 A0A087WUJ7 227 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 DAPL1A0PJW8 107 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 TSPAN2O60636 221 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ARL6IP5O75915 188 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 NIPAL3Q6P499 406 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 OVCH1Q7RTY7 1134 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 OR51G2Q8NGK0 314 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 OR51A7Q8NH64 312 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ICAM5Q9UMF0 924 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 HPP00738 406 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 CD1AP06126 327 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 HEXBP07686 556 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 EPXP11678 715 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 IL12BP29460 328 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 DLX5P56178 289 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 FGL1Q08830 312 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 PLCXD2Q0VAA5 305 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 FHL1Q13642 323 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 LPAL2Q16609 132 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ARL9Q6T311 187 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 GSG1LQ6UXU4 331 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD37Q7Z713 158 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 CPOQ8IVL8 374 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 PHYHIPQ92561 330 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 MRI1Q9BV20 369 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1B0GVC2 190 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 A6NIN4 97 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ANXA2P2A6NMY6 339 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 IDSB3KWA1 339 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 SOCS6O14544 535 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 FLRT2O43155 660 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF264O43296 627 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ONECUT2O95948 504 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 VEGFCP49767 419 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF528Q3MIS6 628 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 CBLN3Q6UW01 205 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 THAP4Q8WY91 577 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 SMOC1Q9H4F8 434 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-204ENST00000352260 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms