RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 GLO1Q04760 184 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PUDPQ08623 228 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 FUT5Q11128 374 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SYPL1Q16563 259 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 XKR7Q5GH72 579 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6YL49 198 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZPA2 131 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PXKQ7Z7A4 578 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKFN1Q8N957 763 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SPERTQ8NA61 448 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SGCDQ92629 289 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PANX1Q96RD7 426 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM15Q9C019 465 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PPCSQ9HAB8 311 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RLIMQ9NVW2 624 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ASIC5Q9NY37 505 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNG2Q9Y698 323 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WUJ7 227 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 FZD7O75084 574 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN15O95858 294 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OPN1MWP04001 364 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 G6PDP11413 515 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NR2C1P13056 603 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTM3P21266 225 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBG1P23258 451 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CD80P33681 288 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A3P33764 101 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP5P55064 265 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MTX3Q5HYI7 312 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf88Q6PI97 169 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD46Q86W74 232 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SKA3Q8IX90 412 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01006Q8NI28 216 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF566Q969W8 418 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TESCQ96BS2 214 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD8Q96LT4 415 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8B2Q96RD0 313 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 EMC6Q9BV81 110 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CHIAQ9BZP6 476 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MARCH7Q9H992 704 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GLTPQ9NZD2 209 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 EMCNQ9ULC0 261 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 VWFP04275 2813 aa6.62□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JPF8 293 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GMNCA6NCL1 334 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC154A6NI56 674 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC30A6NM36 301 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 G3V4G9 280 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RY10O00398 339 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINI2O75830 405 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MT-ATP6P00846 226 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 LIPFP07098 398 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SFTPBP07988 381 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.61□□□□□ -1.35
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