RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r95L7N274 845 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r60L7N2A1 853 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rem1O35929 297 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Irs3O54718 495 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfand5O88878 213 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GfapP03995 430 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AprtP08030 180 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc2a2P14246 523 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il13P20109 131 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tacr1P30548 407 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr12P35412 334 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rph3aP47708 681 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpl6P47911 296 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcyt1aP49586 367 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Polr2iP60898 125 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Samd12Q0VE29 161 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccbe1Q3MI99 408 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem38aQ3TMP8 298 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem64Q3U145 381 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ms4a15Q3UPL6 245 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Akr1clQ3UXL1 322 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hormad2Q5SQP1 306 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bod1Q5SQY2 173 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Snta1Q61234 503 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hesx1Q61658 185 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Epha6Q62413 1035 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Angptl1Q640P2 490 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pan3Q640Q5 837 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mex3bQ69Z36 601 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cep78Q6IRU7 790 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf366Q6NS86 746 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prrg3Q6PAQ9 231 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1045Q7TR80 315 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MtdhQ80WJ7 579 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AftphQ80WT5 931 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tex13c3Q810P0 219 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcyt1bQ811Q9 369 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem127Q8BGP5 238 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pomt2Q8BGQ4 820 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klhl26Q8BGY4 606 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab39aQ8BHD0 217 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clrn3Q8BHH8 226 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aifm2Q8BUE4 373 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Muc20Q8BUE7 656 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tigd4Q8BUZ3 513 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Synpo2lQ8BWB1 975 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrfn5Q8BXA0 719 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc5a8Q8BYF6 611 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LaynQ8C351 381 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Eri3Q8C460 337 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 C330021F23RikQ8C7T0 141 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prmt5Q8CIG8 637 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TrhdeQ8K093 1025 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cnot3Q8K0V4 751 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc31a1Q8K211 196 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cbr3Q8K354 277 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 HopxQ8R1H0 73 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc38a4Q8R1S9 547 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mterf3Q8R3J4 412 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Swsap1Q8VCI7 278 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc92Q8VDN4 314 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ing3Q8VEK6 421 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr777Q8VFH3 311 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr447Q8VGP6 310 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PnpoQ91XF0 261 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chrm5Q920H4 532 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 1810009J06RikQ9CPN7 247 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cmc1Q9CPZ8 106 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem216Q9CQC4 141 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Uqcc2Q9CQY6 136 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Med18Q9CZ82 208 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Srfbp1Q9CZ91 441 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zcchc12Q9CZA5 402 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MmachcQ9CZD0 279 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PyurfQ9D1C3 112 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Agpat5Q9D1E8 365 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nos1apQ9D3A8 503 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stx11Q9D3G5 287 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ptges3lQ9D9A7 131 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mbd3l1Q9D9H3 186 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il23aQ9EQ14 196 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dap3Q9ER88 391 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ifi30Q9ESY9 248 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clcf1Q9QZM3 225 aa4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 VapaQ9WV55 249 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa4.76□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sult2a7A0A1B0GRF0 313 aa4.76□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa4.76□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A0A286YD17 136 aa4.76□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp600A2A7V0 737 aa4.76□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc25a53A2AF28 346 aa4.76□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1247A2AT78 314 aa4.76□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zcchc7B1AX39 541 aa4.76□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kif28pD3YXS5 1028 aa4.76□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm7233E9PZI8 198 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.4 ms