RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tram1Q91V04 374 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl28Q9D1B9 257 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slco1a4Q9EP96 670 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psma6Q9QUM9 246 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TfecQ9WTW4 317 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Epha8O09127 1004 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc16a7O70451 484 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ItgamP05555 1153 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C1qbP14106 253 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2-T3P14432 384 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab2aP53994 212 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rsu1Q01730 277 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdkl3Q8BLF2 595 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr502Q8VG09 314 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem246Q91YV9 403 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 3110001I22RikQ9CZ70 312 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slco6d1Q9D5W6 683 aa11.78□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcrg-V7A0A0A6YYE8 116 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ninj1O70131 152 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DhfrP00375 187 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 VtnP29788 478 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc6a12P31651 614 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MybphlQ5FW53 355 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Guk1Q64520 198 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1162Q7TR28 314 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zer1Q80ZJ6 779 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap22Q8BL80 702 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aifm2Q8BUE4 373 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MepeQ8K4L6 441 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Egln3Q91UZ4 239 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc7a13Q91WN3 478 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HcstQ9QUJ0 79 aa11.77□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1084A0A1L1STZ9 313 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1082A0A1L1SUC9 313 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl8a2O54832 240 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fosl1P48755 273 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Htr1fQ02284 366 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Exosc3Q7TQK4 274 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SelenoiQ80TA1 398 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abhd17aQ99JW1 310 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc25a46Q9CQS4 418 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem186Q9CR76 216 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Art4Q9CRA0 300 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl21Q9D1N9 209 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acot12Q9DBK0 556 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nova1Q9JKN6 507 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Decr2Q9WV68 292 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20489A2AGH5 449 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atxn7l3A2AWT3 347 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm17026K7N6Z0 213 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Amy2P00688 508 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CtgfP29268 348 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FauP35545 74 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eci1P42125 289 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RelbQ04863 558 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyb561Q60720 250 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Orai1Q8BWG9 304 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc22a12Q8CFZ5 553 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1008Q8VGC7 313 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gbgt1Q8VI38 347 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cmtm3Q99LJ5 184 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Emc6Q9CQW0 110 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mbd3l1Q9D9H3 186 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pycr3Q9DCC4 274 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C1galt1c1Q9JMG2 316 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oc90Q9Z0L3 485 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A26c2A0A140LHE4 291 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bmi1P25916 324 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ActbP60710 375 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actg1P63260 375 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nkx6-3Q3UHX8 262 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm525Q3V3I5 90 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam57bQ7TNV1 275 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sez6Q7TSK2 991 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbll1Q80WS3 314 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acp6Q8BP40 418 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mblac1Q8BWY4 260 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmprss11gQ8BZ10 417 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arl6ip5Q8R5J9 188 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr518Q8VEW1 333 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc107Q9DCC3 242 aa11.77□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myo10F8VQB6 2062 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Yjefn3F6W8I0 251 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cldn34aG3UW52 211 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcte3P11985 191 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Isl1P61372 349 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbc1d24Q3UUG6 561 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ZxdcQ8C8V1 858 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1504Q8VFQ4 315 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrgpra6Q91ZC6 301 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr713Q920G5 324 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IckQ9JKV2 629 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polg2Q9QZM2 459 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col4a3Q9QZS0 1669 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KantrA0A1W2P7I0 76 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rdh16f1E9Q9P8 317 aa11.76□□□□□ -0.53
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdhr4H3BJZ2 783 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.1 ms