Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Oc90Q9Z0L3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Oc90Q9Z0L3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Oc90Q9Z0L3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Oc90Q9Z0L3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Oc90Q9Z0L3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Oc90Q9Z0L3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Oc90Q9Z0L3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Oc90Q9Z0L3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Oc90Q9Z0L3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Oc90Q9Z0L3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Oc90Q9Z0L3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Oc90Q9Z0L3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Oc90Q9Z0L3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Oc90Q9Z0L3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Oc90Q9Z0L3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Oc90Q9Z0L3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Oc90Q9Z0L3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Oc90Q9Z0L3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Oc90Q9Z0L3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Oc90Q9Z0L3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Oc90Q9Z0L3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Oc90Q9Z0L3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Oc90Q9Z0L3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Oc90Q9Z0L3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Oc90Q9Z0L3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Oc90Q9Z0L3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Oc90Q9Z0L3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Oc90Q9Z0L3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Oc90Q9Z0L3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Oc90Q9Z0L3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Oc90Q9Z0L3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Oc90Q9Z0L3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Oc90Q9Z0L3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Oc90Q9Z0L3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Oc90Q9Z0L3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Oc90Q9Z0L3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Oc90Q9Z0L3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Oc90Q9Z0L3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Oc90Q9Z0L3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Oc90Q9Z0L3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Oc90Q9Z0L3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Oc90Q9Z0L3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Oc90Q9Z0L3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Oc90Q9Z0L3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Oc90Q9Z0L3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Oc90Q9Z0L3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Oc90Q9Z0L3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Oc90Q9Z0L3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Oc90Q9Z0L3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Oc90Q9Z0L3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Oc90Q9Z0L3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Oc90Q9Z0L3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Oc90Q9Z0L3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Oc90Q9Z0L3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Oc90Q9Z0L3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Oc90Q9Z0L3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Oc90Q9Z0L3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Oc90Q9Z0L3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Oc90Q9Z0L3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Oc90Q9Z0L3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Oc90Q9Z0L3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Oc90Q9Z0L3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Oc90Q9Z0L3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Oc90Q9Z0L3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Oc90Q9Z0L3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Oc90Q9Z0L3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Oc90Q9Z0L3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Oc90Q9Z0L3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Oc90Q9Z0L3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Oc90Q9Z0L3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Oc90Q9Z0L3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Oc90Q9Z0L3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Oc90Q9Z0L3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Oc90Q9Z0L3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Oc90Q9Z0L3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Oc90Q9Z0L3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Oc90Q9Z0L3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Oc90Q9Z0L3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Oc90Q9Z0L3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Oc90Q9Z0L3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Oc90Q9Z0L3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Oc90Q9Z0L3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Oc90Q9Z0L3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Oc90Q9Z0L3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Oc90Q9Z0L3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Oc90Q9Z0L3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Oc90Q9Z0L3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Oc90Q9Z0L3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Oc90Q9Z0L3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Oc90Q9Z0L3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Oc90Q9Z0L3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Oc90Q9Z0L3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Oc90Q9Z0L3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Oc90Q9Z0L3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Oc90Q9Z0L3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Oc90Q9Z0L3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Oc90Q9Z0L3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Oc90Q9Z0L3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Oc90Q9Z0L3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms