RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636966.1

CACNA1A-232, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA1A, Length 3,938 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-232ENST00000636966 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.41□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 AGAP6Q5VW22 663 aa7.41□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 SLC43A2Q8N370 569 aa7.41□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.41□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.41□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 OR2T4Q8NH00 348 aa7.41□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 AGAP4Q96P64 663 aa7.41□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.41□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 TVP23AA6NH52 213 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 H7C1C5 153 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 ORC5O43913 435 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 ZFAND5O76080 213 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 GUSBP08236 651 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 CD82P27701 267 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 MTNR1BP49286 362 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 DCAF7P61962 342 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 LCN6P62502 163 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 BDH1Q02338 343 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 SKP2Q13309 424 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF511Q8NB15 262 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 C3orf49Q96BT1 292 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 ALG12Q9BV10 488 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 NLKQ9UBE8 527 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 SELENOFO60613 162 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 NGFRP08138 427 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 CD14P08571 375 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 FBXO45P0C2W1 286 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 TBXA2RP21731 343 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 EVI2BP34910 448 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 MLF1P58340 268 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 SIRPAP78324 504 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 EFNB1P98172 346 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF117Q03924 483 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 DOC2BQ14184 412 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 HBMQ6B0K9 141 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 OR5J2Q8NH18 312 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 NSMAFQ92636 917 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 WDFY2Q96P53 400 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.4□□□□□ -1.22
CACNA1A-232ENST00000636966 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 E9PI62 339 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 G3V3Y1 287 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 PDCD5O14737 125 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 SSX4O60224 188 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 CCL3P10147 92 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 PLA2G5P39877 138 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 CASP3P42574 277 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 CD83Q01151 205 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 EXT1Q16394 746 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 RFT1Q96AA3 541 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 HES7Q9BYE0 225 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.4□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 MEIOCA2RUB1 952 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 PTP4A3O75365 173 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 CSF3P09919 207 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 SPI1P17947 270 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 NTRK2Q16620 822 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 TPRA1Q86W33 373 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 BEST3Q8N1M1 668 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 TXNDC15Q96J42 360 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 TSSK2Q96PF2 358 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 BEX2Q9BXY8 128 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 DEPPQ9NTK1 212 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 ICAM5Q9UMF0 924 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 TMEM72A0PK05 275 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 ARGFXA6NJG6 315 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 A6NL46 340 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 LYRM1O43325 122 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 PAHP00439 452 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 SERPINA7P05543 415 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 DIO1P49895 249 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 PNLIPRP2P54317 469 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 ACER2Q5QJU3 275 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 SPINK14Q6IE38 97 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-232ENST00000636966 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.39□□□□□ -1.23
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