RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CDC7	O00311	574 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DYNC1I1	O14576	645 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TNFSF11	O14788	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CCNB2	O95067	398 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF250	P15622	560 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SRM	P19623	302 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	AQP2	P41181	271 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CX3CR1	P49238	355 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CAV2	P51636	162 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DSCR10	P59022	87 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF92	Q03936	586 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	HERPUD1	Q15011	391 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PNKD	Q8N490	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PRELID2	Q8N945	189 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CERS2	Q96G23	380 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	FCRL1	Q96LA6	429 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	RGCC	Q9H4X1	137 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM165	Q9HC07	324 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	IL26	Q9NPH9	171 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CLN8	Q9UBY8	286 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	VSIG4	Q9Y279	399 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	EPOP	A6NHQ4	379 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF726	A6NNF4	738 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	USP27X	A6NNY8	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	GABRR3	A8MPY1	467 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	BCKDK	O14874	412 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	FCN3	O75636	299 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SUPT7L	O94864	414 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CHTF8	P0CG12	524 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ZBTB25	P24278	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SSR4	P51571	173 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DAOA	P59103	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	FZD2	Q14332	565 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	NSDHL	Q15738	373 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	NUBPL	Q8TB37	319 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	C16orf74	Q96GX8	76 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A22	Q9H936	323 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PRSS37	A4D1T9	235 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	NDUFAB1	O14561	156 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DPM1	O60762	260 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CD160	O95971	181 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	IFNW1	P05000	195 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SERPINE2	P07093	398 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	KLK2	P20151	261 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CPN2	P22792	545 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CMA1	P23946	247 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CD1B	P29016	333 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	STX17	P56962	302 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	GPNMB	Q14956	572 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	NRF1	Q16656	503 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	MYDGF	Q969H8	173 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CFAP53	Q96M91	514 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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