RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 LYPD4Q6UWN0 246 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 USP43Q70EL4 1123 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 TUBA1AQ71U36 451 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM178AQ8NBL3 297 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2V1Q8NHB1 315 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC39A7Q92504 469 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 INTS14Q96SY0 518 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-207ENST00000589146 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 KLK2P20151 261 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CD97P48960 835 aa20.32■□□□□ 0.84
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CAPNS1-207ENST00000589146 FOXC1Q12948 553 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RFLNBQ8N5W9 214 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 FNDC8Q8TC99 324 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 C4orf36Q96KX1 117 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 DACH2Q96NX9 599 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 COQ7Q99807 217 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPOQ9BU64 300 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SRXN1Q9BYN0 137 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR76Q9H967 626 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ACKR4Q9NPB9 350 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PHYHO14832 338 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 FREM3P0C091 2139 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PGA4P0DJD7 388 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PGA3P0DJD8 388 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 GAAP10253 952 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 GALP22466 123 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CARD18P57730 90 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 OR12D2P58182 307 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PLGLB1Q02325 96 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 BCL2A1Q16548 175 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 THEM4Q5T1C6 240 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PDSS1Q5T2R2 415 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 HBMQ6B0K9 141 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 NOXO1Q8NFA2 376 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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CAPNS1-207ENST00000589146 SIAEQ9HAT2 523 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SSR3Q9UNL2 185 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TVP23AA6NH52 213 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 J3QLW9 94 aa20.3■□□□□ 0.84
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CAPNS1-207ENST00000589146 IGHG1P01857 330 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CD1AP06126 327 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF19P17023 458 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ALOX5APP20292 161 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ENPP1P22413 925 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PAX7P23759 505 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CLDN15P56746 228 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS25P62851 125 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PPIAP62937 165 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 GLO1Q04760 184 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC17A1Q14916 467 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 HIST3H3Q16695 136 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX30Q5JUR7 227 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 VASNQ6EMK4 673 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CREB3L2Q70SY1 520 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 GPAT4Q86UL3 456 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 DCSTAMPQ9H295 470 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC35F4A4IF30 521 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM166BA8MTA8 275 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PLPP2O43688 288 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 HRGP04196 525 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 CELA3AP09093 270 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGEA5P43359 124 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 STARP49675 285 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 LHX2P50458 406 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ETFDHQ16134 617 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-207ENST00000589146 PCK2Q16822 640 aa20.29■□□□□ 0.84
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