RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585313.5

IFT20-215, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

APPRIS P4 TSL 3 BASIC

Gene IFT20, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-215ENST00000585313 PHYHO14832 338 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SLC16A7O60669 478 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ACTL6AO96019 429 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 PGA4P0DJD7 388 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 PGA3P0DJD8 388 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CTLA4P16410 223 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CD79BP40259 229 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 RFC3P40938 356 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CD97P48960 835 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 LHX2P50458 406 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 GLO1Q04760 184 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 NFATC3Q12968 1075 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 GPR50Q13585 617 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SLC10A1Q14973 349 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CDONQ4KMG0 1287 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 THEM4Q5T1C6 240 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CDC20BQ86Y33 519 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ZNF511Q8NB15 262 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SLC39A7Q92504 469 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 RBP7Q96R05 134 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 TSC22D3Q99576 134 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 TIMP4Q99727 224 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 RAMP1O60894 148 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CELA3AP09093 270 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ZNF708P17019 499 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CD53P19397 219 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 PTGS2P35354 604 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CLRN1P58418 232 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 AQP6Q13520 282 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SLC17A1Q14916 467 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 TRILQ7L0X0 811 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 MEIOBQ8N635 442 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 OR10D3Q8NH80 312 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 UCN2Q96RP3 112 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 WDR76Q9H967 626 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 STUB1Q9UNE7 303 aa14.8□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 A0A1W2PPW3 197 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SLC35F4A4IF30 521 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ZNF726A6NNF4 738 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 HSPB2A8KAH6 182 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CXCL13O43927 109 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 HRGP04196 525 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 KLK2P20151 261 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 PCSK6P29122 969 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 GABRA5P31644 462 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 STARP49675 285 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CLDN18P56856 261 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 HSPB2Q16082 182 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SSX6Q7RTT6 188 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 KLBQ86Z14 1044 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SYT14Q8NB59 555 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SNX33Q8WV41 574 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 C4orf36Q96KX1 117 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 RERGLQ9H628 205 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 COPS3Q9UNS2 423 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 RCE1Q9Y256 329 aa14.79□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 DNAJC13O75165 2243 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 TVP23AA6NH52 213 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 UGT2B10P36537 528 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 ENTPD1P49961 510 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CLDN15P56746 228 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 CLDN17P56750 224 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 SPCS2Q15005 226 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 HIST3H3Q16695 136 aa14.78□□□□□ -0.04
IFT20-215ENST00000585313 TEX30Q5JUR7 227 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms