RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PIP5K1C	O60331	668 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	UBL3	O95164	117 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CSF3	P09919	207 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A16	P16260	332 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NPR2	P20594	1047 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PPOX	P50336	477 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	DAG1	Q14118	895 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	MCHR2	Q969V1	340 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF347	Q96SE7	839 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200		J3KTA2	159 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS23	O95084	383 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNW1	P05000	195 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PATE4	P0C8F1	98 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT2	P50583	147 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	LAPTM4A	Q15012	233 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	MSMP	Q1L6U9	139 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NRN1L	Q496H8	165 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT80	Q6KB66	452 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	VWC2L	B2RUY7	222 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX3	O60493	162 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB36	O95755	333 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ACADS	P16219	412 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CLRN1	P58418	232 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FHL1	Q13642	323 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SVOPL	Q8N434	492 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3GL3	Q99963	347 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	RHCG	Q9UBD6	479 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FKBP7	Q9Y680	259 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	COL6A5	A8TX70	2615 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	VSTM5	A8MXK1	200 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFAB1	O14561	156 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CRLF1	O75462	422 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF682	O95780	498 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINA5	P05154	406 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	IFI30	P13284	250 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	MAK	P20794	623 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	DRD4	P21917	467 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB39A	Q14964	217 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	IFI44L	Q53G44	452 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf128	Q5T292	105 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NRM	Q8IXM6	262 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT14	Q8NB59	555 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	18.77	■□□□□ 0.6	4e-7	■■■■□ 19.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTA4	O15217	222 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ENTPD5	O75356	428 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINA1	P01009	418 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PRDX6	P30041	224 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNA8	P32881	189 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GLRX	P35754	106 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PSME3	P61289	254 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	MYBPC1	Q00872	1141 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKCD	Q05655	676 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAM2	Q15035	370 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FXN	Q16595	210 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PPP4C-205	ENST00000563200	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		18.77	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFS8	O00217	210 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NCK1	P16333	377 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	LSP1	P33241	339 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	EVX1	P49640	407 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PDLIM4	P50479	330 aa		18.76	■□□□□ 0.59

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