RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 ZNF74Q16587 644 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 DPPA2Q7Z7J5 298 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 TEX29Q8N6K0 151 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 SNX33Q8WV41 574 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 FAHD2AQ96GK7 314 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 SH3GL3Q99963 347 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 C1orf198Q9H425 327 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 RNF121Q9H920 327 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 CDH20Q9HBT6 801 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 NANSQ9NR45 359 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 TAS2R5Q9NYW4 299 aa20.47■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 TRAV20A0A0B4J274 112 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 C17orf100A8MU93 164 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 DHHO43323 396 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 RP2O75695 350 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 MAGEB1P43366 347 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 LMO4P61968 165 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 RBBP4Q09028 425 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 PCGF3Q3KNV8 242 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 SLC36A2Q495M3 483 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 MMEL1Q495T6 779 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 ENTPD8Q5MY95 495 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 LRFN4Q6PJG9 635 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 SYNPRQ8TBG9 265 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 ARHGDIGQ99819 225 aa20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PBX1-217ENST00000559578 CLPTM1O96005 669 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 PNPP00491 289 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 PTHP01270 115 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 HIST1H2ABP04908 130 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 ACTG1P63261 375 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 CCL8P80075 99 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 MELKQ14680 651 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 DUSP7Q16829 419 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 OR4K5Q8NGD3 323 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 OR6T1Q8NGN1 323 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 C11orf40Q8WZ69 217 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 OR51B6Q9H340 312 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.45■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 M0QX08 132 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 CDC14BO60729 498 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 OPN1SWP03999 348 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 LCKP06239 509 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 QDPRP09417 244 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 PGA4P0DJD7 388 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 PGA3P0DJD8 388 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 CCL2P13500 99 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 ZNF250P15622 560 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 RAD52P43351 418 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 TEKQ02763 1124 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 CYP51A1Q16850 503 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 TBC1D28Q2M2D7 210 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 THSD4Q6ZMP0 1018 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 SLC16A14Q7RTX9 510 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 OR1J2Q8NGS2 313 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 ZNF519Q8TB69 540 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 BCL2L14Q9BZR8 327 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 DYSFO75923 2080 aa20.44■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 SNAP29O95721 258 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 BCL10O95999 233 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 IGHG1P01857 330 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 UMPSP11172 480 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 ATP4BP51164 291 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 PLP2Q04941 152 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 NPTX1Q15818 432 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 NRN1LQ496H8 165 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 ACSM5Q6NUN0 579 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 PTOV1Q86YD1 416 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 LRRC17Q8N6Y2 441 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 DYDC1Q8WWB3 177 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 MPP4Q96JB8 637 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 SLC19A3Q9BZV2 496 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 ZNF665Q9H7R5 613 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.43■□□□□ 0.86
PBX1-217ENST00000559578 PCDHB10Q9UN67 800 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms