RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PQ72 361 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SHISA3A0PJX4 238 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 INHBBP09529 407 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 RORCP51449 518 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SLC25A1P53007 311 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 GLO1Q04760 184 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SRYQ05066 204 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 LIPNQ5VXI9 398 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CORO6Q6QEF8 472 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 UEVLDQ8IX04 471 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 TIGD4Q8IY51 512 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 EXD3Q8N9H8 876 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CEP19Q96LK0 163 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SFXN2Q96NB2 322 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 MMP27Q9H306 513 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 MOKQ9UQ07 419 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 FAM166BA8MTA8 275 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 DOK2O60496 412 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 PSKH1P11801 424 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CASRP41180 1078 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CD97P48960 835 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ACTA2P62736 377 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ACTG2P63267 376 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 GGTLC2Q14390 218 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 OR1C1Q15619 314 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 PXKQ7Z7A4 578 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 RDH10Q8IZV5 341 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SCAIQ8N9R8 606 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 A0A0J9YW62 118 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 NEURL1O76050 574 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CELA3AP09093 270 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ADH6P28332 368 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CCL11P51671 97 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 MAP2K6P52564 334 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 GALNT16Q8N428 558 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ABHD4Q8TB40 342 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ASB10Q8WXI3 467 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 BORCS5Q969J3 196 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 PIGQQ9BRB3 760 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 JAM3Q9BX67 310 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 BRD7Q9NPI1 651 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 FKBP7Q9Y680 259 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 PCSK5Q92824 1860 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 PLPP2O43688 288 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 KRT8P05787 483 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CDAP32320 146 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 NBL1P41271 181 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CLDN17P56750 224 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CLRN1P58418 232 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 ACSM1Q08AH1 577 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 MFAP5Q13361 173 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 CDONQ4KMG0 1287 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 DTX1Q86Y01 620 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 LAX1Q8IWV1 398 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-215ENST00000549143 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms