RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 HSD17B1P14061 328 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ACADSP16219 412 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PCMT1P22061 227 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CALB2P22676 271 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 LOXP28300 417 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NOS3P29474 1203 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CRABP1P29762 137 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 APLNRP35414 380 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 LIPAP38571 399 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 OR1E2P47887 323 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 GSK3BP49841 420 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PDLIM4P50479 330 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RASSF2P50749 326 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS6KA3P51812 740 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGDIAP52565 204 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL27P61353 136 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB1AP62820 205 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NAAAQ02083 359 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TEKQ02763 1124 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CD47Q08722 323 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 GK3PQ14409 553 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PGGHGQ32M88 737 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBED5Q49AG3 693 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR139Q6DWJ6 353 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CGB2Q6NT52 195 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PGM2L1Q6PCE3 622 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ZER1Q7Z7L7 766 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM123Q8N131 208 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC22A24Q8N4F4 322 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR31Q8NA23 367 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM156AQ8NDB6 213 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 WFDC11Q8NEX6 87 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR32P1Q8NGA4 272 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 C11orf40Q8WZ69 217 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM168AQ92567 244 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 HSH2DQ96JZ2 352 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 EMC6Q9BV81 110 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CACNG6Q9BXT2 260 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 BCL2L14Q9BZR8 327 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PLK3Q9H4B4 646 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF442Q9H7R0 627 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SIAEQ9HAT2 523 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CDH20Q9HBT6 801 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 DYNLRB1Q9NP97 96 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CA10Q9NS85 328 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 MED29Q9NX70 200 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CMTM6Q9NX76 183 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TAS2R5Q9NYW4 299 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 MOKQ9UQ07 419 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ENPP4Q9Y6X5 453 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CADP27708 2225 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 USF3Q68DE3 2245 aa4.89□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 HIVEP2P31629 2446 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ANK2Q01484 3957 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PLCE1Q9P212 2302 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 C12orf71A8MTZ7 269 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 E7EQL1 145 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 H7C1Q1 480 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NME4O00746 187 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 IDH3BO43837 385 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFB2O95178 105 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 GADD45GO95257 159 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM107AO95990 144 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PLAUP00749 431 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 IFNA2P01563 188 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV1-44P01699 117 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINA5P05154 406 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 FABP3P05413 133 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SOD3P08294 240 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4A8P0C604 315 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CECR9P0C854 216 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 HLA-DOBP13765 273 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 B4GALT1P15291 398 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 DRD4P21917 467 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NR4A1P22736 598 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PCSK6P29122 969 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 GCH1P30793 250 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NTF4P34130 210 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ACVR1BP36896 505 aa4.88□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 AQP2P41181 271 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms