RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-204ENST00000528201 LIPHQ8WWY8 451 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-204ENST00000528201 ASB10Q8WXI3 467 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-204ENST00000528201 FOXN4Q96NZ1 517 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-204ENST00000528201 MED4Q9NPJ6 270 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-204ENST00000528201 SVEP1Q4LDE5 3571 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-204ENST00000528201 NME4O00746 187 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 IGHG1P01857 330 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 IGHV4-31P0DP07 118 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 THRBP10828 461 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 NR4A2P43354 598 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MYBPC1Q00872 1141 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 LIPEQ05469 1076 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 LAPTM4AQ15012 233 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 SYT14Q8NB59 555 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 NOXO1Q8NFA2 376 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MCHR2Q969V1 340 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa20.64■□□□□ 0.89
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PACSIN3-204ENST00000528201 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 J3KTA2 159 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 FFAR1O14842 300 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 TRMUO75648 421 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 UBL3O95164 117 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB36O95755 333 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC7A2P52569 658 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 CARTPTQ16568 116 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 ARMC4Q5T2S8 1044 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 OR4K5Q8NGD3 323 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 PRRC1Q96M27 445 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 INIPQ9NRY2 104 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MED31Q9Y3C7 131 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 CMAHPQ9Y471 501 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A1W2PRG6 482 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 OR8G3PP0DMU2 310 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 CLRN1P58418 232 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 GGTLC2Q14390 218 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 FXNQ16595 210 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 LRP11Q86VZ4 500 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 HIPK1Q86Z02 1210 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 RHCGQ9UBD6 479 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 NDUFS8O00217 210 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 CXCR6O00574 342 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 SERPINA5P05154 406 aa20.61■□□□□ 0.89
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PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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PACSIN3-204ENST00000528201 GSK3BP49841 420 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 PIMREGQ9BSJ6 248 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 BPESC1Q9GZL8 116 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB1BQ9H0U4 201 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 FZR1Q9UM11 496 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MCIDASD6RGH6 385 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC22O60826 627 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC2A10O95528 541 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 GLRXP35754 106 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 DAP3P51398 398 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 ST3GAL3Q11203 375 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 FHL1Q13642 323 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 SYT3Q9BQG1 590 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 TPK1Q9H3S4 243 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 DYNLRB1Q9NP97 96 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 HIF3AQ9Y2N7 669 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 AP3M1Q9Y2T2 418 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 COL6A5A8TX70 2615 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 VSTM5A8MXK1 200 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 PRSS23O95084 383 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 STAMBPO95630 424 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF682O95780 498 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 IFI30P13284 250 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 CCL2P13500 99 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 DAOP14920 347 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 SEC24CP53992 1094 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 FMODQ06828 376 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 CBLL1Q75N03 491 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 CLDN22Q8N7P3 220 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC75AQ8NAA5 344 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-204ENST00000528201 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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