RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.86□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.86□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.86□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.86□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 MYO10Q9HD67 2058 aa6.86□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1B0GWA3 101 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 MEGF11A6BM72 1044 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 COLCA2A8K830 154 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 C2orf74A8MZ97 194 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC01387J3KSC0 135 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 BRINP1O60477 761 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ACTL6AO96019 429 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 MAS1P04201 325 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CD14P08571 375 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 PTHLHP12272 177 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ADRA2CP18825 462 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ZBTB25P24278 435 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 PPICP45877 212 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 NPBWR1P48145 328 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 PGDP52209 483 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ELOCQ15369 112 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM25Q86YD3 366 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 COMMD1Q8N668 190 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 OR8S1Q8NH09 359 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM106AQ96A25 262 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 RAB7BQ96AH8 199 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ARMC5Q96C12 935 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SERINC2Q96SA4 455 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ALG12Q9BV10 488 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CHST6Q9GZX3 395 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 AICDAQ9GZX7 198 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 OPA3Q9H6K4 179 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 IL21RQ9HBE5 538 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 RHOFQ9HBH0 211 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CKLFQ9UBR5 152 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SPACA6W5XKT8 324 aa6.85□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SIGLEC5O15389 551 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 UPK3AO75631 287 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHV2-70P01814 119 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CD2P06729 351 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CRHP06850 196 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CPMP14384 443 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CSF2RAP15509 400 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 AGAP20933 346 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SDHAP31040 664 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ADH7P40394 386 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 GLP1RP43220 463 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SOX2P48431 317 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CENPAP49450 140 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ATP1B3P54709 279 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CD81P60033 236 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 RAB2AP61019 212 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 IL13RA1P78552 427 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 EMC4Q5J8M3 183 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 FCRL6Q6DN72 434 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 OR10K2Q6IF99 312 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 FDX2Q6P4F2 183 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 GRHL3Q8TE85 626 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 DCUN1D4Q92564 292 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 MCHR2Q969V1 340 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC25A28Q96A46 364 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 COL26A1Q96A83 441 aa6.84□□□□□ -1.31
HMBOX1-211ENST00000524238 SGK3Q96BR1 496 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms