RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 CHRNB3Q05901 458 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PON3Q15166 354 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 UNC50Q53HI1 259 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 HBMQ6B0K9 141 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 MFSD12Q6NUT3 480 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF544Q6NX49 715 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 C3P1Q6ZMU1 363 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZT83 130 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 SH2D5Q6ZV89 423 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 GALNT5Q7Z7M9 940 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF321PQ8N8H1 164 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 OR8J2Q8NGG1 315 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 OR5W2Q8NH69 310 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 FAM110BQ8TC76 370 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 MIPOL1Q8TD10 442 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 RNF128Q8TEB7 428 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 DDIT4LQ96D03 193 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB18Q99592 522 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PINK1Q9BXM7 581 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 RMND5AQ9H871 391 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 FKRPQ9H9S5 495 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 NOX4Q9NPH5 578 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 FBXL17Q9UF56 701 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 LGALS13Q9UHV8 139 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PYCARDQ9ULZ3 195 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 FKBP7Q9Y680 259 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 MED13LQ71F56 2210 aa3.7□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0G2JMM0 328 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PPB8 328 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PRS3 328 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 HTR3EA5X5Y0 456 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 GMNCA6NCL1 334 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 KIR3DP1A8MWS1 328 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 G3V3Y1 287 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 C19orf84I3L1E1 186 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA8RI6L899 631 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 HS3ST1O14792 307 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 WNT9BO14905 357 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 OR2T1O43869 369 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 ZIC3O60481 467 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJB6O75190 326 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFS7O75251 213 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PDE5AO76074 875 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 KCNK2O95069 426 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PMS2P2O95744 297 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 GBAP04062 536 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 IL6P05231 212 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 CT62P0C5K7 136 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 IDO1P14902 403 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A16P16260 332 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 GABRA3P34903 492 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PSMB10P40306 273 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 PTGDSP41222 190 aa3.69□□□□□ -1.82
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HDAC2-216ENST00000523628 KHKP50053 298 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 HTR6P50406 440 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 CDH13P55290 713 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 CLDN15P56746 228 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 CLDN8P56748 225 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 COPZ1P61923 177 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 EMX2Q04743 252 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 SPOCK1Q08629 439 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 HSPB3Q12988 150 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 ITGADQ13349 1161 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA0040Q15053 153 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 GUSBP1Q15486 140 aa3.69□□□□□ -1.82
HDAC2-216ENST00000523628 STK11Q15831 433 aa3.69□□□□□ -1.82
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