RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516414.1

RNU6-1049P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1049, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1049P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TTLL9Q3SXZ7 439 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 KLHL12Q53G59 568 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF311Q5JNZ3 666 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 LIN9Q5TKA1 542 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RAB12Q6IQ22 244 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 NANOGP8Q6NSW7 305 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SMARCD3Q6STE5 483 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ARL9Q6T311 187 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 AFTPHQ6ULP2 937 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CBLN3Q6UW01 205 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CD164L2Q6UWJ8 174 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PET117Q6UWS5 81 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 DNM1P46Q6ZS02 220 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 Q6ZSR3 168 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ARCQ7LC44 396 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SLC16A13Q7RTY0 426 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 NEGR1Q7Z3B1 354 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PRNTQ86SH4 94 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 BIVMQ86UB2 503 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TPRA1Q86W33 373 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IFNEQ86WN2 208 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IQCA1Q86XH1 822 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CBWD2Q8IUF1 395 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 C15orf53Q8NAA6 179 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 C11orf72Q8NBR9 251 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 Q8NDZ9 215 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CCDC54Q8NEL0 328 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 C1orf64Q8NEQ6 169 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 OR8J1Q8NGP2 316 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 OR1S2Q8NGQ3 325 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 OR5C1Q8NGR4 320 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 OR2K2Q8NGT1 345 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 PIFOQ8TCI5 191 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 C15orf40Q8WUR7 153 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SDR42E1Q8WUS8 393 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 FGF14Q92915 247 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 UCN3Q969E3 161 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TMEM54Q969K7 222 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CLDN23Q96B33 292 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CREB3L1Q96BA8 519 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SERPINB12Q96P63 405 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CSPG4P5Q96PW8 444 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 OR4K3Q96R72 315 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TSPAN18Q96SJ8 248 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 NRIP2Q9BQI9 281 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ADPGKQ9BRR6 497 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TMEM59Q9BXS4 323 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SAMD10Q9BYL1 202 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ROGDIQ9GZN7 287 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 DPH5Q9H2P9 285 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RBKSQ9H477 322 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ECT2Q9H8V3 914 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SLC25A22Q9H936 323 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ANKRA2Q9H9E1 313 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 RETNQ9HD89 108 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MID1IP1Q9NPA3 183 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 FBXO8Q9NRD0 319 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SLC17A7Q9P2U7 560 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ATXN10Q9UBB4 475 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MTFP1Q9UDX5 166 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MAD2L2Q9UI95 211 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ASF1AQ9Y294 204 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 AP4B1Q9Y6B7 739 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CCDC88CQ9P219 2028 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF462Q96JM2 2506 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SDK1Q7Z5N4 2213 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CCDC7Q96M83 1385 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 SLX4Q8IY92 1834 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ICE1Q9Y2F5 2266 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ATP8B3O60423 1300 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 MROH7Q68CQ1 1323 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 OTOFQ9HC10 1997 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 TRAV40A0A0B4J280 105 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1049P-201ENST00000516414 A0A1B0GVL5 298 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 187.6 ms