RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512554.1

GCSHP1-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP1, Length 484 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP1-201ENST00000512554 MND1Q9BWT6 205 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RNF122Q9H9V4 155 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SIAEQ9HAT2 523 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 DKKL1Q9UK85 242 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 KLK13Q9UKR3 277 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.7□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 MED12Q93074 2177 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 DNAJC13O75165 2243 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 A0A0J9YW62 118 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 A0A1B0GVC2 190 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 A0A1W2PRG6 482 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SULT2B1O00204 365 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RNF13O43567 381 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 INMTO95050 263 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ACTL6AO96019 429 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PTHP01270 115 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 HRGP04196 525 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 OR2T7P0C7T2 308 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF708P17019 499 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PTNP21246 168 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 GALP22466 123 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SHC1P29353 583 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CRABP1P29762 137 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 WNT4P56705 351 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TLE3Q04726 772 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PIGFQ07326 219 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PON3Q15166 354 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SPHARQ15513 63 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 OR7A5Q15622 319 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 STK11Q15831 433 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CTF1Q16619 201 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 OR2T27Q8NH04 317 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 OR4K13Q8NH42 304 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 OR6X1Q8NH79 312 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 C5orf34Q96MH7 638 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 NMNAT3Q96T66 252 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 MGLLQ99685 303 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ASB6Q9NWX5 421 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 PIEZO1Q92508 2521 aa6.69□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ACACAQ13085 2346 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 FAM183AA6NL82 134 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 H3BML4 177 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 XKRYO14609 159 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 ZNF432O94892 652 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 OR6A2O95222 327 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 TSPAN15O95858 294 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 BCL10O95999 233 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RENP00797 406 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 LCKP06239 509 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 NR2C1P13056 603 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CPN1P15169 458 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CPEP16870 476 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 MYL12AP19105 171 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 CCNA2P20248 432 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 LIPAP38571 399 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 MAP2K4P45985 399 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 RGS6P49758 472 aa6.68□□□□□ -1.34
GCSHP1-201ENST00000512554 LHX2P50458 406 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms