RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 FOLR3P41439 243 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 MLF1P58340 268 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 EGR3Q06889 387 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 FDX2Q6P4F2 183 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SETD6Q8TBK2 473 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ASB10Q8WXI3 467 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DDIT4LQ96D03 193 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DIRAS2Q96HU8 199 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TAAR9Q96RI9 348 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 INTS14Q96SY0 518 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 NEURL2Q9BR09 285 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZPBPQ9BS86 351 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CHST11Q9NPF2 352 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXL2Q9UKC9 423 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PADI1Q9ULC6 663 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 MPDZO75970 2070 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PNV4 684 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 A6NIZ1 184 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 HSPB2A8KAH6 182 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PHYHO14832 338 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC19A2O60779 497 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 GPANK1O95872 356 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CSF3P09919 207 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 IL7P13232 177 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CTLA4P16410 223 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 AHCYP23526 432 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 MYL9P24844 172 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ADH6P28332 368 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 P2RY4P51582 365 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10A3P58181 314 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RAP1BP61224 184 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RAP1AP62834 184 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PUDPQ08623 228 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CHAF1BQ13112 559 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 OR7A5Q15622 319 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 HSPB2Q16082 182 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 YIF1BQ5BJH7 314 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 LIPNQ5VXI9 398 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM205BPQ63HN1 556 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CNIH2Q6PI25 160 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 WDFY1Q8IWB7 410 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 OTOSQ8NHW6 89 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CT55Q8WUE5 264 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 NXPE2Q96DL1 559 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DDA1Q9BW61 102 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 STRADBQ9C0K7 418 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CDCP1Q9H5V8 836 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TIGARQ9NQ88 270 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SERINC1Q9NRX5 453 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 VDAC3Q9Y277 283 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.68□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 IGF2RP11717 2491 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087WZY1 265 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 CENPBD1B2RD01 187 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC16A7O60669 478 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL6IP5O75915 188 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFPL1O95159 310 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-DQB1P01920 261 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT8P05787 483 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 TFPIP10646 304 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 RFX2P48378 723 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFA1P59665 94 aa9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms