RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FMO6PO60774 539 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NKX2-2O95096 273 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NDUFB2O95178 105 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IFNGP01579 166 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PROS1P07225 676 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADRA2CP18825 462 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DIO1P49895 249 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LGALS4P56470 323 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSPAN5P62079 268 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BTG2P78543 158 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PITPNAQ00169 270 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PON3Q15166 354 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CSRP2Q16527 193 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AANATQ16613 207 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TCTE1Q5JU00 501 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM65Q6PI78 240 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YAF2Q8IY57 180 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HGDQ93099 445 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR1F2PQ96R84 312 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ULBP3Q9BZM4 244 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GDE1Q9NZC3 331 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF224Q9NZL3 707 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AUP1Q9Y679 476 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BDP1A6H8Y1 2624 aa5.96□□□□□ -1.45
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 A6NCN8 305 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF879B4DU55 563 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FOXS1O43638 330 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAD1O60671 282 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARL6IP5O75915 188 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SERPINA3P01011 423 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DBHP09172 617 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDK2P24941 298 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LCN1P31025 176 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUDT1P36639 197 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AQP2P41181 271 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 P2RX1P51575 399 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACTC1P68032 377 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACTA1P68133 377 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HSF2Q03933 536 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MELKQ14680 651 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIR2DS3Q14952 304 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LEG1Q6P5S2 330 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CSNK1A1LQ8N752 337 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR51A4Q8NGJ6 313 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SGTBQ96EQ0 304 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NOX3Q9HBY0 568 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LYRM4Q9HD34 91 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HRASLS2Q9NWW9 162 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF69Q9UC07 566 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNN3Q9UGI6 736 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DMDP11532 3685 aa5.96□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRT33AO76009 404 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR7A10O76100 309 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAS1P04201 325 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DYRK1AQ13627 763 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ALG11Q2TAA5 492 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HACD4Q5VWC8 232 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR5M10Q6IEU7 315 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC22A18Q96BI1 424 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SFXN2Q96NB2 322 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CFAP54Q96N23 3096 aa5.95□□□□□ -1.46
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms