RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MOK	Q9UQ07	419 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508		B4DXG7	233 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TF	P02787	698 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GRPR	P30550	384 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	S100A5	P33763	92 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	RORC	P51449	518 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FOXK1	P85037	733 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FOXO1	Q12778	655 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TM9SF2	Q99805	663 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	INIP	Q9NRY2	104 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF208	O43345	1280 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	RNF13	O43567	381 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CDRT1	O95170	752 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	REN	P00797	406 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MAP2K6	P52564	334 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ACTA2	P62736	377 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ACTG2	P63267	376 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	HSF2	Q03933	536 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MEST	Q5EB52	335 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	VASN	Q6EMK4	673 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SYS1	Q8N2H4	156 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SNX18	Q96RF0	628 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	NCKAP5	O14513	1909 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508		J3QLW9	94 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	LRRTM2	O43300	516 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	SERPINI2	O75830	405 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHM	P01871	453 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	CELA3A	P09093	270 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF19	P17023	458 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	GNLY	P22749	145 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	MAGEA5	P43359	124 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	HSF1	Q00613	529 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	FOXF1	Q12946	379 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	SNTA1	Q13424	505 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAM1	Q15629	374 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	ARSK	Q6UWY0	536 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	SIAH3	Q8IW03	269 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	GHDC	Q8N2G8	530 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	GNRHR2	Q96P88	292 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	ALG12	Q9BV10	488 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	GABRP	O00591	440 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	PLPP3	O14495	311 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	OR6A2	O95222	327 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF12	P17014	697 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	CD40LG	P29965	261 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	PYCR1	P32322	319 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	ETV6	P41212	452 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	PPP5C	P53041	499 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	OR12D2	P58182	307 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMEM18-208	ENST00000497508	RUNX1T1	Q06455	604 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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