RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATG4C	Q96DT6	458 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	AP1S3	Q96PC3	154 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	CERS4	Q9HA82	394 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCND3	Q9UK17	655 aa		7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPP5D1	E7EU14	171 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SOCS6	O14544	535 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TP53I11	O14683	189 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF749	O43361	778 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAPLN	O95428	1278 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMP2	P08253	660 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRM	P19623	302 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	DTYMK	P23919	212 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR3DL2	P43630	455 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR4	P46093	362 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CX3CR1	P49238	355 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST1H3A	P68431	136 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEMG2	Q02383	582 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PMS2P11	Q13670	270 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	DCAF10	Q5QP82	559 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SYT9	Q86SS6	491 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NKD1	Q969G9	470 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PARP11	Q9NR21	331 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF181	Q9P0P0	153 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PEX12	O00623	359 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GJB1	P08034	283 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDK3	Q00526	305 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	EFEMP1	Q12805	493 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM159	Q96B96	161 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TVP23C	Q96ET8	276 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM12	Q96EX1	92 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SAMD8	Q96LT4	415 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	IP6K3	Q96PC2	410 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM117A	Q9C073	453 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOX4	Q9NPH5	578 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAPPA	Q13219	1627 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549		H7C417	338 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549		H7C4K7	107 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB27B	O00194	218 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAN2B1	O00754	1011 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	INSIG1	O15503	277 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TOX4	O94842	621 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRGC2	P03986	189 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAS1	P04201	325 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPS	P0C0P6	89 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	IMPA1	P29218	277 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10J1	P30954	320 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAS2R50	P59544	299 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMAN2	Q12907	356 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MIB2	Q96AX9	1013 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUDT11	Q96G61	164 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	DERL3	Q96Q80	235 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	VAMP8	Q9BV40	100 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		7.52	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		7.52	□□□□□ -1.21

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