RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GNGT2O14610 69 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ITGB1BP1O14713 200 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 STK17BO94768 372 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CST1P01037 141 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OPN1LWP04000 364 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 THBS1P07996 1170 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CEACAM1P13688 526 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 AQP1P29972 269 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SSTR4P31391 388 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PPICP45877 212 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OMPP47874 163 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 INPP1P49441 399 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB5CP51148 216 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC37A1P57057 533 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 POU4F2Q12837 409 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SLAMF9Q96A28 289 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TPD52L3Q96J77 140 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SDF2Q99470 211 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNJ15Q99712 375 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 Q9N2J8 555 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR45Q9Y484 360 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 V9GYQ6 96 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 USP34Q70CQ2 3546 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2W5A6NFC9 320 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FRG2CA6NGY1 282 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TSTD3H0UI37 97 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TM4SF5O14894 197 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FADS1O60427 444 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RP2O75695 350 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SERPINA3P01011 423 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RD3LP0DJH9 198 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DRD5P21918 477 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CD82P27701 267 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GABRA3P34903 492 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SMSP52788 366 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PSG6Q00889 435 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFRSF9Q07011 255 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 EIPR1Q53HC9 387 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ATCAYQ86WG3 371 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 MISPQ8IVT2 679 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB24Q969Q5 203 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 ABCB9Q9NP78 766 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 SEC16AO15027 2179 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087X0M5 115 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GX30 115 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 C9orf172C9J069 976 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 HRKO00198 91 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV2-5P01817 119 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 OPN1SWP03999 348 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNW1P05000 195 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-211ENST00000493660 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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