RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 OXGR1Q96P68 337 aa6.6□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 SNX18Q96RF0 628 aa6.6□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 MCHR1Q99705 422 aa6.6□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ASPNQ9BXN1 380 aa6.6□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 NELFAQ9H3P2 528 aa6.6□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.6□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.6□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.6□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 GMNCA6NCL1 334 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 CENPBD1B2RD01 187 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 TRIM77I1YAP6 450 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 MGRN1O60291 552 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ENTPD5O75356 428 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 DCTN3O75935 186 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 BGLAPP02818 100 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 CECR9P0C854 216 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 CCNA2P20248 432 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 DRD4P21917 467 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 CALCRP30988 508 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 IFNA8P32881 189 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 THBS4P35443 961 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 CDH12P55289 794 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 SELENOWP63302 87 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 PUDPQ08623 228 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ZP4Q12836 540 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 BNIP2Q12982 314 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 NPTX1Q15818 432 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 FXNQ16595 210 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 RINLQ6ZS11 566 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF627Q7L945 461 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 AAED1Q7RTV5 226 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 TEX29Q8N6K0 151 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 SMYD1Q8NB12 490 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 TAAR8Q969N4 342 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM186Q96B77 213 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 RCN3Q96D15 328 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 JMJD8Q96S16 334 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF747Q9BV97 191 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 NDE1Q9NXR1 346 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 ARMCX1Q9P291 453 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.59□□□□□ -1.35
RBBP4-211ENST00000477563 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 VSTM5A8MXK1 200 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 M0R082 166 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 M0R3H8 397 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 SLC43A1O75387 559 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 KRT34O76011 436 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 LYPD3O95274 346 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 TFP02787 698 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 OPN1SWP03999 348 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 MSMBP08118 114 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 TSPAN19P0C672 248 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 IFNGR1P15260 489 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 CBR1P16152 277 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 NPR2P20594 1047 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 GRPRP30550 384 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 MNAT1P51948 309 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 ACTG1P63261 375 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 HOXC5Q00444 222 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF74Q16587 644 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 NRN1LQ496H8 165 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 CBLL1Q75N03 491 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 LINGO2Q7L985 606 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 GPAT4Q86UL3 456 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 OR5J2Q8NH18 312 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.58□□□□□ -1.36
RBBP4-211ENST00000477563 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms