RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 OR5M10Q6IEU7 315 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 PRR22Q8IZ63 422 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 TAAR8Q969N4 342 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 TAS2R10Q9NYW0 307 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF69Q9UC07 566 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 A0A1B0GTQ1 180 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 PLSCR5A0PG75 271 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 MEIS3P1A6NDR6 274 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 FAM25EA8MYX2 175 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 PDCD5O14737 125 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 RAD1O60671 282 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 KDM4BO94953 1096 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 WNT11O96014 354 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 CALCBP10092 127 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ALOX5APP20292 161 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 GRK6P43250 576 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 KIR3DL2P43630 455 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 GABRA4P48169 554 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 GUCA2AQ02747 115 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 GRM7Q14831 915 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 CLLU1Q5K131 121 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 METTL11BQ5VVY1 283 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 GPAT4Q86UL3 456 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 LIPHQ8WWY8 451 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 LRRC61Q9BV99 259 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 OR2M5A3KFT3 312 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 CDC14CA4D256 554 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 C17orf105B2RV13 164 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 NDUFB6O95139 128 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ITGA5P08648 1049 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 THEGLP0DJG4 465 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 RABIFP47224 123 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ART1P52961 327 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 GFERP55789 205 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 H2BFSP57053 126 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF626Q68DY1 528 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 SLC6A19Q695T7 634 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 FAM198BQ6UWH4 519 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ADGRG3Q86Y34 549 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 PM20D2Q8IYS1 436 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 OR51D1Q8NGF3 324 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 M0R233 179 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 SIX6O95475 246 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 TXNDC12O95881 172 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 FBXO45P0C2W1 286 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 TACR3P29371 465 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 SLC37A1P57057 533 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 WDR38Q5JTN6 314 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 ST8SIA4Q92187 359 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 IFT46Q9NQC8 304 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 GPR27Q9NS67 375 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 KIF26BQ2KJY2 2108 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-214ENST00000473778 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms