RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 APOA1P02647 267 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 TFP02787 698 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 SP1P08047 785 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 GDF1P27539 372 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 ZNF85Q03923 595 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 TPBGQ13641 420 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 MELKQ14680 651 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 NDUFA5Q16718 116 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 SLC39A7Q92504 469 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 HES7Q9BYE0 225 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 OR51E2Q9H255 320 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 FKBP7Q9Y680 259 aa14.66□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 AQP7P3A6NL99 342 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 TRAPPC6AO75865 159 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 H3F3AP84243 136 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 RUNX1T1Q06455 604 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 TMEM225Q6GV28 225 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 KLHL15Q96M94 604 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 OXGR1Q96P68 337 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 B9D1Q9UPM9 204 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 MED12Q93074 2177 aa14.65□□□□□ -0.06
USP20-204ENST00000472108 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 NME2P1O60361 137 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 SELENOFO60613 162 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 LALBAP00709 142 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 NME2P22392 152 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 CENPAP49450 140 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 CCL11P51671 97 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 HCCSP53701 268 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 BDH1Q02338 343 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 CCDC190Q86UF4 302 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 UEVLDQ8IX04 471 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 ZNF511Q8NB15 262 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 UFD1Q92890 307 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 SFXN2Q96NB2 322 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 FREM3P0C091 2139 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 A0A0J9YW62 118 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 SLC35F4A4IF30 521 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 LINC01387J3KSC0 135 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 MT-ND5P03915 603 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 CD46P15529 392 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 CAPZA2P47755 286 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 STEAP3Q658P3 488 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 POC5Q8NA72 575 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 HPS1Q92902 700 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 KCNK17Q96T54 332 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 MED29Q9NX70 200 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 RASD1Q9Y272 281 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.64□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 SLC16A7O60669 478 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 HPNP05981 417 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 CRABP1P29762 137 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 CRYBB2P43320 205 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 BLVRAP53004 296 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 GFRA1P56159 465 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 ARG2P78540 354 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 SSX6Q7RTT6 188 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 GPAT4Q86UL3 456 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 AKAP14Q86UN6 197 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 KLBQ86Z14 1044 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 TIGD4Q8IY51 512 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 WDFY2Q96P53 400 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 MFRPQ9BY79 579 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 RERGLQ9H628 205 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 MARCH7Q9H992 704 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 KLK13Q9UKR3 277 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 STUB1Q9UNE7 303 aa14.63□□□□□ -0.07
USP20-204ENST00000472108 NCKAP5O14513 1909 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms