RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	MCHR2	Q969V1	340 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	BOD1	Q96IK1	185 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CCL19	Q99731	98 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	REEP1	Q9H902	201 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	POMP	Q9Y244	141 aa		15.5	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	DHRS12	A0PJE2	317 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902		A6NIZ1	184 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF9	O43307	516 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ATE1	O95260	518 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	MAGEA2	P43356	314 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ART1	P52961	327 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CDH11	P55287	796 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RAP1B	P61224	184 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RAP1A	P62834	184 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	PIGF	Q07326	219 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NPRL3	Q12980	569 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR2T29	Q8NH02	315 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NSMAF	Q92636	917 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	FBXW5	Q969U6	566 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CHID1	Q9BWS9	393 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902		U3KQV3	271 aa		15.49	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CENPBD1	B2RD01	187 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	XKRY	O14609	159 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	GNGT2	O14610	69 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	PTP4A3	O75365	173 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SLC2A10	O95528	541 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	IGHM	P01871	453 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	HLA-H	P01893	362 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CD14	P08571	375 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NR2C1	P13056	603 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CD53	P19397	219 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	PAX7	P23759	505 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	FMOD	Q06828	376 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	MDP1	Q86V88	176 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	FANK1	Q8TC84	345 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	HTRA1	Q92743	480 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902		Q96M85	177 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF570	Q96NI8	536 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RBP7	Q96R05	134 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	GPA33	Q99795	319 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		15.48	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SHISA9	B4DS77	424 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ENTPD5	O75356	428 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CCNB2	O95067	398 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CST1	P01037	141 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CBR1	P16152	277 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	HMGA2	P52926	109 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	HIST3H3	Q16695	136 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	LINC00471	Q8N535	108 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF611	Q8N823	705 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF519	Q8TB69	540 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	PIGT	Q969N2	578 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	KCNK17	Q96T54	332 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SH3GL3	Q99963	347 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ALG12	Q9BV10	488 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	MOK	Q9UQ07	419 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		15.47	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	USF3	Q68DE3	2245 aa		15.46	■□□□□ 0.07

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