RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454561.2

TRBV5-4-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV5-4, Length 544 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-4-201ENST00000454561 CHRNB3Q05901 458 aa6.5□□□□□ -1.37
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TRBV5-4-201ENST00000454561 HIST3H3Q16695 136 aa6.5□□□□□ -1.37
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TRBV5-4-201ENST00000454561 ALG10Q5BKT4 473 aa6.5□□□□□ -1.37
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TRBV5-4-201ENST00000454561 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.49□□□□□ -1.37
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TRBV5-4-201ENST00000454561 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV5-4-201ENST00000454561 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV5-4-201ENST00000454561 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.48□□□□□ -1.37
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TRBV5-4-201ENST00000454561 UNC119BA6NIH7 251 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV5-4-201ENST00000454561 A6NIZ1 184 aa6.48□□□□□ -1.37
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