RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 C1orf123Q9NWV4 160 aa15.79■□□□□ 0.12
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PTPRF-209ENST00000438120 SLC35A4Q96G79 324 aa15.79■□□□□ 0.12
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PTPRF-209ENST00000438120 PPP2CAP67775 309 aa15.78■□□□□ 0.12
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PTPRF-209ENST00000438120 ACSM1Q08AH1 577 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRF-209ENST00000438120 HES1Q14469 280 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRF-209ENST00000438120 STEAP3Q658P3 488 aa15.78■□□□□ 0.12
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PTPRF-209ENST00000438120 PPT1P50897 306 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRF-209ENST00000438120 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRF-209ENST00000438120 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
PTPRF-209ENST00000438120 GRINAQ7Z429 371 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRF-209ENST00000438120 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
PTPRF-209ENST00000438120 TSLPQ969D9 159 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRF-209ENST00000438120 ABHD6Q9BV23 337 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRF-209ENST00000438120 GPR173Q9NS66 373 aa15.77■□□□□ 0.11
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