RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASB6Q9NWX5 421 aa15.01□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.01□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPRKBQ9Y3C4 175 aa15.01□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATMQ13315 3056 aa15.01□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC16A7O60669 478 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM20BO75063 409 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLCEO94923 617 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL2RAP01589 272 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLUP10909 449 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTNR1AP48039 350 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT6P53370 316 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF91Q05481 1191 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 POU4F2Q12837 409 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR137CQ8N3F9 429 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 APH1AQ96BI3 265 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSSK2Q96PF2 358 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTYH2Q9BSA4 534 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00470Q9BZP3 86 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 HAO2Q9NYQ3 351 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 B9D1Q9UPM9 204 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRGMA1A4Y4 181 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCTN6O00399 190 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 XPNPEP2O43895 674 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GYPBP06028 91 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 QDPRP09417 244 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTLA4P16410 223 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC15A1P46059 708 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 PER3P56645 1201 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLO1Q04760 184 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCTD21Q4G0X4 260 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHL22Q53GT1 634 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCHR2Q969V1 340 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMBNQ9NP70 447 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 DSPP15924 2871 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC182A6NF36 153 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR3A2P47893 321 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GABARAPL2P60520 117 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 FMODQ06828 376 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB40BQ12829 278 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GGTLC2Q14390 218 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 STK11Q15831 433 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf128Q5T292 105 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRFN4Q6PJG9 635 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNFT2Q96EX2 444 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 RERGLQ9H628 205 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TINAGQ9UJW2 476 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITPR1Q14643 2758 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 E9PLN8 166 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT33AO76009 404 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOXO94900 526 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLI4P10075 376 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSTT1P30711 240 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 PYCR1P32322 319 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC35A2P78381 396 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GGHQ92820 318 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYDGFQ969H8 173 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUSP21Q9H596 190 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.98□□□□□ -0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms