RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372478.4

C9orf50-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene C9orf50, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50-201ENST00000372478 CEACAM16Q2WEN9 425 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ARMC4Q5T2S8 1044 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 FAHD1Q6P587 224 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 OR52N5Q8NH56 324 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 HSD17B8Q92506 261 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 LRR1Q96L50 414 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TXNIPQ9H3M7 391 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 IL20RAQ9UHF4 553 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ITPR2Q14571 2701 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 H0YAE9 185 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 CTAG2O75638 210 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 PGA4P0DJD7 388 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 PGA3P0DJD8 388 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ARF1P84077 181 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TIMM23BQ5SRD1 257 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TTC23Q5W5X9 447 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 OR7E24Q6IFN5 339 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 C1orf94Q6P1W5 598 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TMEM200AQ86VY9 491 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF555Q8NEP9 628 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TMEM54Q969K7 222 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 FEVQ99581 238 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 KATNB1Q9BVA0 655 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ULBP2Q9BZM5 246 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 KRT84Q9NSB2 600 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 DEFB108AA8MXU0 73 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 IGHG1P01857 330 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 FPR3P25089 353 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 CAPGP40121 348 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 FXYD6P3P58550 94 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 KRTAP10-9P60411 292 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ERVK-25P63136 954 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 SLC36A3Q495N2 470 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 HIKESHIQ53FT3 197 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 THSD4Q6ZMP0 1018 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 SYT14Q8NB59 555 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 OR1K1Q8NGR3 316 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 CYGBQ8WWM9 190 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF570Q96NI8 536 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TSPAN32Q96QS1 320 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 GLTPQ9NZD2 209 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 APCP25054 2843 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 NPIPB13A6NJU9 1138 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 NPIPB4C9JG80 1138 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TRMUO75648 421 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 SEC14L2O76054 403 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 NDUFB2O95178 105 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 GSSP48637 474 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 CLRN1P58418 232 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 RPL27P61353 136 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 PPA1Q15181 289 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 MUCL1Q96DR8 90 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 PIK3IP1Q96FE7 263 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 RASSF1Q9NS23 344 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ABCA4P78363 2273 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 A0A096LPE4 126 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 A0A1W2PPZ6 126 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 FAM221AA4D161 298 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 IGHMP01871 453 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 HRGP04196 525 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ACVR1BP36896 505 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 MYBPC1Q00872 1141 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 P2RY8Q86VZ1 359 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 WDR31Q8NA23 367 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 AQP11Q8NBQ7 271 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 NOXO1Q8NFA2 376 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 FANK1Q8TC84 345 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TOR3AQ9H497 397 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 SLC17A5Q9NRA2 495 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 MGAT4BQ9UQ53 548 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 GASTP01350 101 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 CD14P08571 375 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TSPAN31Q12999 210 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 TBRG1Q3YBR2 411 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 LRFN4Q6PJG9 635 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 SMARCD3Q6STE5 483 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 HDDC2Q7Z4H3 204 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 CNBD2Q96M20 576 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 ANKRD60Q9BZ19 345 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 NDEL1Q9GZM8 345 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf50-201ENST00000372478 NELFAQ9H3P2 528 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms