RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 RENP00797 406 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 CALCBP10092 127 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 AP3S2P59780 193 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 VWA2Q5GFL6 755 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 METTL11BQ5VVY1 283 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 GPR139Q6DWJ6 353 aa22.92■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 KLHL15Q96M94 604 aa22.92■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 C2orf68Q2NKX9 166 aa22.92■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa22.92■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.91■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 GLSO94925 669 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa22.91■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 OR8S1Q8NH09 359 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 RAB40AQ8WXH6 277 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 A0A1B0GUH1 482 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa22.91■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 BLKP51451 505 aa22.91■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 ARPC4P59998 168 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa22.91■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa22.91■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 PDE7BQ9NP56 450 aa22.91■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 CXCL2P19875 107 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 SQSTM1Q13501 440 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 CSRP2Q16527 193 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 ANGPTL6Q8NI99 470 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 RLN1P04808 185 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 MYF5P13349 255 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 SERTAD2Q14140 314 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 ELFN2Q5R3F8 820 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 SIGIRRQ6IA17 410 aa22.9■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 LIPHQ8WWY8 451 aa22.9■■□□□ 1.26
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HOXB3-201ENST00000311626 OR11A1Q9GZK7 315 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 TRAV18A0A075B6X5 111 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 MPZL1O95297 269 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 SPARCP09486 303 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 RORAP35398 523 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 MELKQ14680 651 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 C1orf189Q5VU69 101 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 GPR148Q8TDV2 347 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 TTC9Q92623 222 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 ADIPOR1Q96A54 375 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 GPR27Q9NS67 375 aa22.89■■□□□ 1.26
HOXB3-201ENST00000311626 CFAP54Q96N23 3096 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 C2orf72A6NCS6 295 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 NAP1L6A6NFF2 107 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 C10orf142B7Z368 130 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 M0R233 179 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
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HOXB3-201ENST00000311626 OLFML2AQ68BL7 652 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF227Q86WZ6 799 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 OR4C16Q8NGL9 310 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF721Q8TF20 911 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 C4orf45Q96LM5 186 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 ADAM19Q9H013 955 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 CUTCQ9NTM9 273 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 PTTG3PQ9NZH4 202 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 UBQLN2Q9UHD9 624 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 STEAP1Q9UHE8 339 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM150CB9EJG8 249 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 SULT1B1O43704 296 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF254O75437 659 aa22.88■■□□□ 1.25
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