RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CARTPTQ16568 116 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 C3AR1Q16581 482 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC58Q4VC31 144 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNJQ5T5M9 372 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IDNKQ5T6J7 187 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MTFR2Q6P444 385 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL9Q6T311 187 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SHFQ7M4L6 423 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM99Q8N816 258 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2T27Q8NH04 317 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PFN4Q8NHR9 129 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SMPDL3BQ92485 455 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC7A6Q92536 515 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 THRSPQ92748 146 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 RFT1Q96AA3 541 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IP6K3Q96PC2 410 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MNTQ99583 582 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 STMN3Q9NZ72 180 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 COPZ2Q9P299 210 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS13CQ709C8 3753 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM221AA4D161 298 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SERINC4A6NH21 518 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 B4DXG7 233 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IMPA2O14732 288 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF749O43361 778 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 RDH16O75452 317 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 OR7A10O76100 309 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC2A10O95528 541 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R3DO95685 299 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CBX7O95931 251 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 F10P00742 488 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CSTAP01040 98 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 UMODP07911 640 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HPGDP15428 266 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NPR2P20594 1047 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TBXA2RP21731 343 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX18P35713 384 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC6A8P48029 635 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 RFX2P48378 723 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 PITPNBP48739 271 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN20P56880 219 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 HSD17B7P56937 341 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX8P57073 446 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CD300CQ08708 224 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATC1Q76KD6 591 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TRILQ7L0X0 811 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 NOXA1Q86UR1 476 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCE1-201ENST00000264640 CADM2Q8N3J6 435 aa6.35□□□□□ -1.39
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