RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Emc4Q9CZX9 183 aa16.08■□□□□ 0.17
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Wdsub1Q9D0I6 474 aa16.08■□□□□ 0.17
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nmrk2Q9D7C9 195 aa16.08■□□□□ 0.17
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 SlirpQ9D8T7 112 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Armc8Q9DBR3 673 aa16.08■□□□□ 0.17
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr2Q9QWU6 327 aa16.08■□□□□ 0.17
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tenm4Q3UHK6 2771 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cldn24D3YXJ9 220 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NgpO08692 167 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Prdx4O08807 274 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sh2b3O09039 548 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cbr1P48758 277 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Wdr75Q3U821 830 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nutm2Q3V0C3 733 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc17a4Q5NCM1 492 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Klk1b21Q61759 261 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1135Q7TR42 310 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc6a15Q8BG16 729 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr170Q8VGL6 313 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Spryd4Q91WK1 207 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Asf1bQ9DAP7 202 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Entpd4Q9DBT4 613 aa16.08■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zfp534A2A7A1 661 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zfp54E9PW05 585 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Susd1E9Q3H4 752 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mst1P26928 716 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc22a15Q504N2 544 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm21093Q6GQS8 569 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NelfaQ8BG30 530 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nyap2Q8BM65 682 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kctd11Q8K485 232 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NaxeQ8K4Z3 282 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Coq6Q8R1S0 476 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Swsap1Q8VCI7 278 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr862Q8VFJ1 306 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 9230110F15RikQ9D262 117 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Coro7Q9D2V7 922 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hormad1Q9D5T7 392 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 UqcrbQ9D855 111 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tspan32Q9JHH2 256 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nkain4Q9JMG4 208 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 LipaQ9Z0M5 397 aa16.07■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1303A2AVW1 312 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc22a28B2RT89 552 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fkbp7O54998 218 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 AmbnO55189 407 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MndaP0DOV1 425 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ifi204P0DOV2 619 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 TraddQ3U0V2 310 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Isg20l2Q3U1G5 368 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm8773Q3UQ24 132 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Obox3Q3UT54 335 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tas2r104Q7M723 302 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Smap2Q7TN29 428 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Katnb1Q8BG40 658 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tbl1xr1Q8BHJ5 514 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfml2aQ8BHP7 681 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Steap3Q8CI59 488 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Akr1d1Q8VCX1 325 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Znf385aQ8VD12 386 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr668Q8VGW3 318 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sf3b5Q923D4 86 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc22a30Q96LX3 552 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Uqcrc1Q9CZ13 480 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 OxsmQ9D404 459 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dapl1Q9D757 107 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Eif3kQ9DBZ5 218 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr887Q9EQA6 309 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Aloxe3Q9WV07 711 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NgfrQ9Z0W1 417 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cmya5Q70KF4 3739 aa16.06■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mettl7a3G3X9G9 244 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 F10O88947 481 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 SrcP05480 541 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 TpoP35419 914 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 IbspQ61711 324 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zfp866Q6PGD2 520 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P4ha3Q6W3F0 542 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr591Q7TRR7 314 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Teddm1aQ810U2 305 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr692Q8VF03 329 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fndc8Q9D2H8 321 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Znf346Q9R0B7 294 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr396-ps1A0A0U1RNF5 211 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm20219A0A1B0GRQ3 87 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr896-ps1A0A1L1SRZ8 308 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm438B1ASB3 393 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vmn2r101E9PZS9 857 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm3636E9Q5P1 227 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 C1dO35473 141 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Creg1O88668 220 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hoxb2P0C1T1 354 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fkbp2P45878 140 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Entpd6Q3U0P5 455 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Btnl1Q7TST0 509 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sh2d7Q8BI17 458 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dlgap5Q8K4R9 808 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1272Q8VGN8 308 aa16.05■□□□□ 0.16
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Setd6Q9CWY3 473 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.7 ms