RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LILRB2Q8N423 598 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR11L1Q8NGX0 322 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 C17orf50Q8WW18 174 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RASD2Q96D21 266 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR5M11Q96RB7 305 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC61Q9BV99 259 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MYOTQ9UBF9 498 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SMCO3A2RU48 225 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 B8ZZF3 427 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 E9PI62 339 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 H7C1C5 153 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TOXO94900 526 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 GLSO94925 669 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MT-CO2P00403 227 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ARRB2P32121 409 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LCN6P62502 163 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RAB31Q13636 194 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 HTR4Q13639 388 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 FGFBP1Q14512 234 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SLC22A6Q4U2R8 563 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 LAX1Q8IWV1 398 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR4K15Q8NH41 348 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 PSMF1Q92530 271 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ARL11Q969Q4 196 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 COX14Q96I36 57 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 NICN1Q9BSH3 213 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 WDR90Q96KV7 1748 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087WUU8 490 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 GPR137BO60478 399 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SELENOFO60613 162 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 HSF1Q00613 529 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TNK1Q13470 666 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ACBD4Q8NC06 268 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RAB3CQ96E17 227 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CTRCQ99895 268 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0D9SG52 128 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SBK2P0C263 348 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SHC1P29353 583 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 GPR85P60893 370 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RUNX2Q13950 521 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 DPY19L4Q7Z388 723 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 SLC35B4Q969S0 331 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 C7orf34Q96L11 122 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ANKUB1A6NFN9 424 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 DVL2O14641 736 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 MTCP1P56278 107 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CXADRP78310 365 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 BLOC1S1P78537 153 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 KCNAB1Q14722 419 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 KCNJ8Q15842 424 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 OR51A2Q8NGJ7 313 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TTC9Q92623 222 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-228ENST00000636120 TOMM40LQ969M1 308 aa5.93□□□□□ -1.46
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