RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX12Q9BXU0 123 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 PRRG3Q9BZD7 231 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP21Q9H596 190 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN3BQ9NY72 215 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA1O95477 2261 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BML4 177 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 PTP4A3O75365 173 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 WBP4O75554 376 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 POU1F1P28069 291 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP2K6P52564 334 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 GINS1Q14691 196 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC27A4Q6P1M0 643 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CASP12Q6UXS9 341 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF620Q6ZNG0 422 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX47Q8TBZ9 253 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM234Q8WY98 164 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 Q96MT0 163 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CR1P17927 2039 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 SHISA8B8ZZ34 492 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC1A7O00341 560 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TFAP2AP05549 437 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9A3P48764 834 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKDD1AQ495B1 522 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM201Q5SNT2 666 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF563Q8TA94 476 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM171Q8WVE6 324 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ST8SIA1Q92185 356 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 MED17Q9NVC6 651 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFA13Q9P0J0 144 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB9A8MZ26 197 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01387J3KSC0 135 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC42EP2O14613 210 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 PIP5K1CO60331 668 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGN1P05114 100 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 MAKP20794 623 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 OCLNQ16625 522 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ELOA3BQ3SY89 546 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF773Q6PK81 442 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 C5orf46Q6UWT4 87 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF611Q8N823 705 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ELOA3Q8NG57 546 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 PFN4Q8NHR9 129 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 CNIH3Q8TBE1 160 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF217Q8TC41 542 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 APH1BQ8WW43 257 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRG7Q96K78 797 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 C20orf141Q9NUB4 165 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-216ENST00000628306 HS3ST1O14792 307 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX14O95416 240 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 NTN1O95631 604 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 IL11P20809 199 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR4P46093 362 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 CCR4P51679 360 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 MEDAGQ5VYS4 303 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM236Q5W0B7 351 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PTCHD4Q6ZW05 846 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 GRINAQ7Z429 371 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6K3Q8NGY3 331 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2FQ969M7 185 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SGTBQ96EQ0 304 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 NPAS1Q99742 590 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC4AQ9UMR7 237 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 BAIAP2Q9UQB8 552 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SIGLEC7Q9Y286 467 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 TMCC2O75069 709 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP3CBP16298 524 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 TACR3P29371 465 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5J2P56134 94 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A53Q5H9E4 307 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6S1Q8NH40 331 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PLPPR2Q96GM1 343 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC38A2Q96QD8 506 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 CXorf56Q9H5V9 222 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 CLN6Q9NWW5 311 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OVOL3O00110 214 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH3B2P48448 385 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35A2P78381 396 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 QPRTQ15274 297 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBED5Q49AG3 693 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSM5Q6NUN0 579 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2T33Q8NG76 320 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 TSSK6Q9BXA6 273 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms