RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SKA3Q8IX90 412 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENONQ9NZV5 590 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SLAMF8Q9P0V8 285 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ERLIN1O75477 346 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CSNK1A1P48729 337 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 COMPP49747 757 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH12P55289 794 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 REEP3Q6NUK4 255 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR88Q6ZMY6 472 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT73Q86Y46 540 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 FAHD2AQ96GK7 314 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF416Q9BWM5 594 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF385DQ9H6B1 395 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM27Q9HBJ8 222 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL3Q9UKT7 428 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 AVPP01185 164 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPNS1-211ENST00000590874 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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CAPNS1-211ENST00000590874 SCGB2A2Q13296 93 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 LRIF1Q5T3J3 769 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN32Q96QS1 320 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM43Q9BTV4 400 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPNS1-211ENST00000590874 TENM1Q9UKZ4 2725 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV20A0A0B4J274 112 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf98E9PRG8 122 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CLPTM1O96005 669 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PNPP00491 289 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM157BP0CG42 384 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHA1P21709 976 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 LSP1P33241 339 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 HILS1P60008 231 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 NKPD1Q17RQ9 610 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM54Q969K7 222 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 IKZF5Q9H5V7 419 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 G6PC2Q9NQR9 355 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TAAR3PQ9P1P4 343 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC105371242A0A075B767 164 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM89A2RUT3 159 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC14BO60729 498 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 EGR1P18146 543 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP1P29972 269 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 MYBPC1Q00872 1141 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SCARB2Q14108 478 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 AVPI1Q5T686 147 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A24Q8N4F4 322 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5J2Q8NH18 312 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPNS1-211ENST00000590874 ADORA3P0DMS8 318 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL2P13500 99 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVS71-1P61550 626 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL8P80075 99 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PAGE3Q5JUK9 113 aa21.9■■□□□ 1.1
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CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf56Q8N813 242 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC30A7Q8NEW0 376 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3GL3Q99963 347 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51B6Q9H340 312 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF665Q9H7R5 613 aa21.9■■□□□ 1.1
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CAPNS1-211ENST00000590874 MVKQ03426 396 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 USP43Q70EL4 1123 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35D2Q76EJ3 337 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6X1Q8NH79 312 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM38AQ9H6F2 299 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM38BQ9NVV0 291 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC13A4Q9UKG4 626 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 USH1CQ9Y6N9 552 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R3H8 397 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8G3PP0DMU2 310 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 STX1BP61266 288 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MELKQ14680 651 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSM5Q6NUN0 579 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 LRFN4Q6PJG9 635 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 EPGNQ6UW88 154 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00114Q6XXX2 140 aa21.88■■□□□ 1.09
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