RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 CXCR6O00574 342 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 FFAR1O14842 300 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 PDE5AO76074 875 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR7A10O76100 309 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRSS23O95084 383 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 HEXAP06865 529 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 CECR9P0C854 216 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 IFNGR1P15260 489 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 FUT1P19526 365 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 CD33P20138 364 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 ARR3P36575 388 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 CDKN1AP38936 164 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR1E2P47887 323 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 GSK3BP49841 420 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 BIDP55957 195 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 TAS2R41P59536 307 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 NAAAQ02083 359 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 CAMK2DQ13557 499 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 FXNQ16595 210 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 MST1LQ2TV78 715 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 DEF8Q6ZN54 512 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 MUC15Q8N387 334 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUP37Q8NFH4 326 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 PFN4Q8NHR9 129 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM239Q8WW34 195 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 LZICQ8WZA0 190 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 SGTBQ96EQ0 304 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMR3AQ99954 134 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 GLTPQ9NZD2 209 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 MOKQ9UQ07 419 aa6.44□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A096LNT2 108 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 C11orf98E9PRG8 122 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 RNF13O43567 381 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 NDUFS7O75251 213 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR6A2O95222 327 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 LY6G6DO95868 133 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 CRYAAP02489 173 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 HIST1H2ABP04908 130 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 IFNW1P05000 195 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 PGA4P0DJD7 388 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 PGA3P0DJD8 388 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 FUT4P22083 530 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 AHCYP23526 432 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 CALCRP30988 508 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 CSNK1A1P48729 337 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUDT2P50583 147 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 FABP6P51161 128 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSME3P61289 254 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 TUBA1BP68363 451 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 TUBA4AP68366 448 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 IL1RL1Q01638 556 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 HGFACQ04756 655 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 ST3GAL3Q11203 375 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 TNK1Q13470 666 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 FHL1Q13642 323 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 EFNB3Q15768 340 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 NRN1LQ496H8 165 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 CARD17Q5XLA6 110 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 TUBA1AQ71U36 451 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 MDP1Q86V88 176 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2CP4-201ENST00000561405 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.6 ms