RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 ACER3Q9NUN7 267 aa8.13□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 MKLN1Q9UL63 735 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.13□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 E9PQ18 207 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 MED21Q13503 144 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.12□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.11□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 GATSQ8NAP1 163 aa8.11□□□□□ -1.11
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SMAD3-215ENST00000560424 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF570Q96NI8 536 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.11□□□□□ -1.11
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF747Q9BV97 191 aa8.11□□□□□ -1.11
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