RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 BIVMQ86UB2 503 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 OR2G2Q8NGZ5 317 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MFRPQ9BY79 579 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 LANCL2Q9NS86 450 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF69Q9UC07 566 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLC22A13Q9Y226 551 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 FREM3P0C091 2139 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 OR4C45A6NMZ5 311 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 KDM4BO94953 1096 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 WNT11O96014 354 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ALDOBP05062 364 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CD1AP06126 327 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 HSF2Q03933 536 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 DMWDQ09019 674 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 IL10RAQ13651 578 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MDGA2Q7Z553 956 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 OR4D10Q8NGI6 311 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MGAT4CQ9UBM8 478 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PRODH2Q9UF12 536 aa16.05■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 A0A1W2PPC4 97 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ANXA2P2A6NMY6 339 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 GUSBP08236 651 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PNMTP11086 282 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MYF5P13349 255 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ART1P52961 327 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CBFBQ13951 182 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MEP1BQ16820 701 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 VWA2Q5GFL6 755 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TOR2AQ5JU69 321 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 FGD2Q7Z6J4 655 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 HGDQ93099 445 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 HAVCR1Q96D42 359 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLC19A3Q9BZV2 496 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ICMTO60725 284 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 IL33O95760 270 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TACSTD2P09758 323 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 KIR3DL2P43630 455 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLC25A1P53007 311 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ISXQ2M1V0 245 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 KDM8Q8N371 416 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 NXPE2Q96DL1 559 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PLEKHA1Q9HB21 404 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PLCL2Q9UPR0 1127 aa16.04■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 C10orf142B7Z368 130 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SIX6O95475 246 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ALOX5APP20292 161 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TSPAN5P62079 268 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 WDR38Q5JTN6 314 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLC6A19Q695T7 634 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 NUDT9Q9BW91 350 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 GPR27Q9NS67 375 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SKP1P63208 163 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ESCO2Q56NI9 601 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 OR5M10Q6IEU7 315 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 C17orf50Q8WW18 174 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MIB2Q96AX9 1013 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 COQ3Q9NZJ6 369 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa16.03■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 CRYZL1O95825 349 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PNPP00491 289 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2ABP04908 130 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF250P15622 560 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SNTA1Q13424 505 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SQSTM1Q13501 440 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 TCTE1Q5JU00 501 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 FAM69AQ5T7M9 428 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 PHYHIPQ92561 330 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 RBP7Q96R05 134 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 OR1F2PQ96R84 312 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 INTS14Q96SY0 518 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 OR11A1Q9GZK7 315 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 SLITRK2Q9H156 845 aa16.02■□□□□ 0.16
XRCC3-218ENST00000557439 C2orf72A6NCS6 295 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 LCN1P31025 176 aa16.02■□□□□ 0.15
XRCC3-218ENST00000557439 CCKBRP32239 447 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms