RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	EPYC	Q99645	322 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ASPN	Q9BXN1	380 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM120B	A0PK00	339 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	C11orf98	E9PRG8	122 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	CDC14B	O60729	498 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	CLPTM1	O96005	669 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PNP	P00491	289 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SERPINA5	P05154	406 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM157B	P0CG42	384 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	CCL2	P13500	99 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	EPHA1	P21709	976 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	AHCY	P23526	432 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	CSNK1A1	P48729	337 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	CDH12	P55289	794 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	BID	P55957	195 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	HILS1	P60008	231 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	NCALD	P61601	193 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	CDK6	Q00534	326 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	AVPI1	Q5T686	147 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	REEP3	Q6NUK4	255 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PXK	Q7Z7A4	578 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	OR51B6	Q9H340	312 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	C17orf100	A8MU93	164 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ADORA3	P0DMS8	318 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	AQP1	P29972	269 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ARFIP2	P53365	341 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ERVS71-1	P61550	626 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	CCL8	P80075	99 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	MVK	Q03426	396 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SCGB2A2	Q13296	93 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	USP43	Q70EL4	1123 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SNX32	Q86XE0	403 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT73	Q86Y46	540 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	C3orf56	Q8N813	242 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM54	Q969K7	222 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SH3GL3	Q99963	347 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	GLTP	Q9NZD2	209 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SELENON	Q9NZV5	590 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	VAPA	Q9P0L0	249 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM77	I1YAP6	450 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	MPZL1	O95297	269 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ADRA2C	P18825	462 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	LSP1	P33241	339 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SCARB2	Q14108	478 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	MELK	Q14680	651 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5J2	Q8NH18	312 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	ESM1	Q9NQ30	184 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	CACNG2	Q9Y698	323 aa		10.73	□□□□□ -0.69
LETMD1-231	ENST00000551931	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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