RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 OR4A16Q8NH70 328 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 C7orf34Q96L11 122 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 EMC7Q9NPA0 242 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 TVP23AA6NH52 213 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 LMO7DNF2Z398 122 aa7.82□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 C18orf63Q68DL7 685 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.82□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 EGLN2Q96KS0 407 aa7.82□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF728P0DKX0 622 aa7.82□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.82□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa7.82□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 DRD5P21918 477 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 GPR157Q5UAW9 335 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZTK2 550 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 SNAPINO95295 136 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 HSF1Q00613 529 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 AGBL4Q5VU57 503 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRB-208ENST00000550358 COMMD7Q86VX2 200 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF573Q86YE8 665 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 VRK3Q8IV63 474 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 LFNGQ8NES3 379 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 OR52I1Q8NGK6 324 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-208ENST00000550358 GPR78Q96P69 363 aa7.81□□□□□ -1.16
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