RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	CST1	P01037	141 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV3-13	P01766	116 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CRYGB	P07316	175 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC35E2	P0CK97	266 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC130	P13994	396 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GAL	P22466	123 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HOXA9	P31269	272 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MS4A2	Q01362	244 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OGDH	Q02218	1023 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TGM3	Q08188	693 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HTR4	Q13639	388 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RUNX3	Q13761	415 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GRB7	Q14451	532 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ISX	Q2M1V0	245 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	LIN9	Q5TKA1	542 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2L3	Q8NG85	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FMO2	Q99518	471 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SOST	Q9BQB4	213 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	DPH7	Q9BTV6	452 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GLRX2	Q9NS18	164 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NFASC	O94856	1347 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	LAMA4	Q16363	1823 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ACACA	Q13085	2346 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0J9YWU9	116 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GUS0	222 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308		B4DXG7	233 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NMT2	O60551	498 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SH3BGRL	O75368	114 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FGF4	P08620	206 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ADORA2B	P29275	332 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CASP14	P31944	242 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PTGDS	P41222	190 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	EFNA3	P52797	238 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC8A3	P57103	927 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SP4	Q02446	784 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TRDN	Q13061	729 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	LPAL2	Q16609	132 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC66	Q68CR7	880 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	HPS6	Q86YV9	775 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SVOPL	Q8N434	492 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	METTL13	Q8N6R0	699 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	AGR3	Q8TD06	166 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MS4A14	Q96JA4	679 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF2	Q99496	336 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB34	Q9BZG1	259 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	SENP1	Q9P0U3	644 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	PHF11	Q9UIL8	331 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	KLK13	Q9UKR3	277 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		3.13	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms