RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533413.5

CKAP5-212, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CKAP5, Length 3,084 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-212ENST00000533413 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4.96□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.96□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 FOXQ1Q9C009 403 aa4.96□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.96□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.96□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 BIN3Q9NQY0 253 aa4.96□□□□□ -1.62
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CKAP5-212ENST00000533413 OR51B4Q9Y5P0 310 aa4.96□□□□□ -1.62
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CKAP5-212ENST00000533413 K7EQS6 105 aa4.95□□□□□ -1.62
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CKAP5-212ENST00000533413 HERV-K104P63124 156 aa4.95□□□□□ -1.62
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CKAP5-212ENST00000533413 SMCO1Q147U7 214 aa4.95□□□□□ -1.62
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CKAP5-212ENST00000533413 OR2G6Q5TZ20 316 aa4.95□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 UQCC3Q6UW78 93 aa4.95□□□□□ -1.62
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CKAP5-212ENST00000533413 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 SYT14Q8NB59 555 aa4.95□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa4.95□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 OR1M1Q8NGA1 313 aa4.95□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 HAVCR1Q96D42 359 aa4.95□□□□□ -1.62
CKAP5-212ENST00000533413 RNFT2Q96EX2 444 aa4.95□□□□□ -1.62
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