RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519081.1

RNU6-988P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 988, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-988P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-988P-201ENST00000519081 RPA4Q13156 261 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 PHYHD1Q5SRE7 291 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 AP1ARQ63HQ0 302 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 DNAJC24Q6P3W2 148 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CALHM1Q8IU99 346 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 PIANPQ8IYJ0 282 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CCDC170Q8IYT3 715 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 NKAIN3Q8N8D7 197 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM186Q96B77 213 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 AMDHD1Q96NU7 426 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 OXGR1Q96P68 337 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF607Q96SK3 696 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 RBKSQ9H477 322 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 MID1IP1Q9NPA3 183 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 A0A0U1RQV5 110 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 NPIPA7E9PJI5 369 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 PFKFB2O60825 505 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 NPIPA8P0DM63 369 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CCDC130P13994 396 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 MAP3K8P41279 467 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CDKN2BP42772 138 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 NPBWR2P48146 333 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 NAPAP54920 295 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 IFT88Q13099 833 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 PON2Q15165 354 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC15A2Q16348 729 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 STUMQ69YW2 141 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 Q6ZSA8 131 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 PGAP1Q75T13 922 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 ABHD13Q7L211 337 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 IPMKQ8NFU5 416 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 OR5D13Q8NGL4 314 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 OR4S2Q8NH73 311 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 IP6K3Q96PC2 410 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 RAB17Q9H0T7 212 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 SYTL2Q9HCH5 934 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 PALMDQ9NP74 551 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 PARP11Q9NR21 331 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 GIN1Q9NXP7 522 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CBY1Q9Y3M2 126 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 ANKRD12Q6UB98 2062 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 KDRP35968 1356 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 BTNL10A8MVZ5 291 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 E7EQL1 145 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 H0YJW9 148 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CLDN5O00501 218 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 UPK3AO75631 287 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 HLA-DQB1P01920 261 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 FABP3P05413 133 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 IL1RNP18510 177 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 SFNP31947 248 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 AQP2P41181 271 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 TDO2P48775 406 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLA2G16P53816 162 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 LDLRAP1Q5SW96 308 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM222AQ5U5X8 452 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 TPGS2Q68CL5 300 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CNIH2Q6PI25 160 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 ERASQ7Z444 233 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 KIAA1328Q86T90 577 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC35G3Q8N808 338 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 SGK3Q96BR1 496 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 NSMCE2Q96MF7 247 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 GBA3Q9H227 469 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 REEP4Q9H6H4 257 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 ACTR8Q9H981 624 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 GNG12Q9UBI6 72 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 MMP17Q9ULZ9 603 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 COPS3Q9UNS2 423 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 SDHAF1A6NFY7 115 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 INAFM2P0DMQ5 153 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF250P15622 560 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 MUTP22033 750 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 SYKP43405 635 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 OXA1LQ15070 435 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CCDC40Q4G0X9 1142 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 ARMC3Q5W041 872 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC16A13Q7RTY0 426 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 CLEC4FQ8N1N0 589 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 TBL1YQ9BQ87 522 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 OSBPL10Q9BXB5 764 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 GSDMCQ9BYG8 508 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-988P-201ENST00000519081 LTBP2Q14767 1821 aa0.15□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms