RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508029.5

NSD1-208, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 1, human

TSL 2

Gene NSD1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD1-208	ENST00000508029	HLA-H	P01893	362 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	NPR2	P20594	1047 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	THBS4	P35443	961 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	SELENOW	P63302	87 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	NPRL3	Q12980	569 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	MICU2	Q8IYU8	434 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	HTRA1	Q92743	480 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	ZNF566	Q969W8	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	DOK1	Q99704	481 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	MGRN1	O60291	552 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	CCDC22	O60826	627 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	OR7A10	O76100	309 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	UBL3	O95164	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	BCL10	O95999	233 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	PGA4	P0DJD7	388 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	PGA3	P0DJD8	388 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	UMPS	P11172	480 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	CD79A	P11912	226 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	ZNF35	P13682	527 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	B4GALT1	P15291	398 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	FUT1	P19526	365 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	NR4A1	P22736	598 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	PDLIM4	P50479	330 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	VLDLR	P98155	873 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	DAG1	Q14118	895 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	HIST3H3	Q16695	136 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	DEF8	Q6ZN54	512 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	TMEM239	Q8WW34	195 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	RCN3	Q96D15	328 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	SGTB	Q96EQ0	304 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	NOX3	Q9HBY0	568 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029		A0A1W2PRG6	482 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	TMEM129	A0AVI4	362 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	VWC2L	B2RUY7	222 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	DHH	O43323	396 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	GPRIN2	O60269	458 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	TNFRSF1B	P20333	461 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	OR1E2	P47887	323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	EVX1	P49640	407 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	UGT2B15	P54855	530 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	RAB1A	P62820	205 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	ST3GAL3	Q11203	375 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	SKA3	Q8IX90	412 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	LZIC	Q8WZA0	190 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	MED31	Q9Y3C7	131 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NSD1-208	ENST00000508029	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	LY6H	O94772	140 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	RAB36	O95755	333 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	IGHG1	P01857	330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	COX4I1	P13073	169 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	IFNA8	P32881	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	GLRX	P35754	106 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	GIPR	P48546	466 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	PIGF	Q07326	219 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	MELK	Q14680	651 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NSD1-208	ENST00000508029	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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